治疗植物神经紊乱，要保持良好情绪，良好的情绪有利于神经系统与各器官、系统的协调统一，使机体的生理代谢处于好的状态。症状严重时，可进行专业心理干预治疗，提高自己的心理应对能力。自我调整心态、放松精神。
植物神经紊乱该可以先通过心理干预的方法改善，可以调理一下心情，通过和朋友交流、听音乐等方法改善，也可以找心理咨询师沟通，同时要注意改善自己的生活环境，养成规律作息的习惯。
中医主要采用辨证施治的方法。分为三型论治：肾阴虚证：表现为月经紊乱，月经周期缩短，量少或量多，或崩或漏，头晕，耳鸣，面颊阵发性烘热，出汗，腰膝酸痛，足跟疼，或皮肤干燥，口干便结，尿少色黄，舌红少苔，脉细数。肾阳虚证：表现为月经量多，精神萎靡，面色灰暗，腰背冷痛，小便清长，夜尿频数，或面浮肢肿，舌苔薄白，脉沉细弱。肾阴阳俱虚证：表现为月经紊乱，头晕耳鸣，健忘，腰背冷痛，舌淡，苔薄，脉沉弱。
植物神经紊乱属于精神、心理类疾病，因此治疗以抗焦虑、抗抑郁为主，临床常见药物有五羟色胺再摄取抑制剂、谷维素等，在用药同时，还可接受心理治疗，并养成良好生活习惯，规律作息、积极运动、保持心情愉悦。植物神经紊乱与精神和心理因素密切相关，能够很好的自我调整。
植物神经紊乱在一两个月后，就会有明显的改善，最重要的就是要调理好心理。出现植物神经功能紊乱的话，可能会表现为失眠或是头晕，甚至可以出现一些焦虑抑郁的症状，严重的影响到人的正常生活，工作学习。
植物神经紊乱能自愈，肠胃神经功能紊乱主要的原因是思想有压力，精神过度紧张所致。一定要适当的放松一下自己的情绪，不要有太大的思想压力。避免精神紧张，就没大问题，还可以吃一些药，这样就可以很好的改善不适，还要加强体育锻炼，让身体疲惫，然后再多吃蔬菜，水果，多喝水，避免精神压力过大，不能让胃受刺激。