没有特效治疗方法，主要是对症治疗、支持治疗和防治并发症、如头痛严重者可用止痛药，脑水肿可适当应用甘露醇。抗病毒治疗可明显缩短病程和缓解症状，针对单纯性疱疹病毒及EB病毒多用药物治疗。如果脑炎严重的，可以造成运动，感觉功能障碍，有以上表现的，需要按医嘱口服调理神经功能的药物对改善以上症状有很好的作用。
中医治疗：但传统中医治疗脑炎后遗症疗程很慢，效果不是很理想，长期下去会造成有些患者体质的一定副作用。一般治疗及对症治疗：护理、降温、止惊以及呼吸衰竭等处理可参照乙脑的治疗。
可以采用药物治疗在相结合康复训练，要控制颅内高压、高热和抽搐发作尤为重要，精心护理可防止继发感染，注意饮食，生活要规律，也可去正规医院诊断后在配合医生治疗。
脑炎的后遗症主要有：1、脑炎累及人体运动神经，引发运动功能障碍，导致四肢无力、活动能力受限的后遗症；2、脑炎发病部位本来就属于大脑，因此更容易损害大脑神经引发智力障碍；3、疾病累及语言神经，引发失语后遗症；4、眼球麻痹也是脑炎的后遗症之一，由于这种疾病也容易让视觉神经受损；5、脑炎也容易引发肌肉萎缩的后遗症。
脑炎患者有后遗症之后，应该采用抗病毒药物治疗，采用抗病毒的药物治疗主要是为了提高患者的机体抵抗力，患者如果出现了高热情况，就应该及时的采用物理降温或者是退烧药进行治疗了。
需要专业的医生做体格检查和相应的实验室检查，头颅影像学检查、脑电图、腰穿脑脊液检查，这三大项检查综合来分析，到医生做完腰穿检查，脑脊液正常，就认为已经可以排除脑膜炎。