手术与药物联合治疗：手术治疗前给予3-6个月的药物治疗，使异位病灶缩小、软化，有利于缩小手术范围和手术操作。对保守性手术、手术不彻底或术后疼痛不缓解者，术后给予药物治疗，推迟复发。保留卵巢功能手术：切除盆腔内病灶及子宫，保留至少一侧或部分卵巢。适用于III、IV期患者、症状明显且无生育要求的45岁以下患者。
子宫内膜异位可以采取以下方式进行锻炼。
1、术前：子宫内膜异位病有发生破裂的危险，如果做的比较大，有些病人可能会发生翻转。所以，大的囊，要尽量不要做太激烈的运动，但是一般的游泳、慢跑是可以的。
2、手术后的一个多月，也就是在恢复的这段时间里，尽量不要做太大的运动，在恢复期之后不要做运动，可以参加跑步、跳、游泳等各种运动。
子宫内膜异位症手术后应注意事项：1女性月经期一定杜绝性生活；2月经期间，禁止一切激烈运动及体力劳动；月经期要做学会控制情绪，不要生闷气，否则会导致内分泌失调;少做人工流产和刮宫，做好计划生育；4随时调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常；要注意自身保暖，避免受寒着凉；饮食上应该注意营养的丰富和健康，注意休息。
治疗应采用如下方法。手术治疗：卵巢上发生的巧克力囊肿，病变体积往往较大，发生在其他部位的子宫内膜异位结节，直径在2厘米以上者，不易用药物控制，要把它切开，把里面的这个囊肿剥掉。假绝经疗法：使用促性腺激素释放的药物，强烈地抑制卵巢的功能，使其几乎完全失去作用，从而达到治疗目的。
子宫内膜异位症有西医手术治疗与中医保守治疗。手术治疗：分保守手术及手术两种。年轻或尚需保留生育机能的女性，可行子宫内膜异位囊肿剥除术及病灶切除术为保守手术；对不要再生育的女性，可行全部子宫及病灶切除，保留一侧或双侧部分卵巢，术后辅以药物治疗，复发率较低；近绝经期的妇女可行手术，行全子宫、双卵巢、输卵管切除术以及病灶切除术可避免复发。
子宫内膜异位适合艾灸，因为子宫内膜异位症可以导致月经不调、痛经的情况，甚至还可以导致不孕不育的情况发生。艾灸对子宫内膜异位症还是有效果的，可以活血化瘀，对子宫内膜炎症可以起到消炎以及预防的效果。但是艾灸治疗见效慢，所以治疗需要耐心，坚持治疗。再有需要找有经验的中医进行治疗，不要自行艾灸，因为需要找准对应的穴位。
