如何处理甲减和亚临床，应根据病人具体情况决定。
如亚临床甲减患者，通常无症状，也无体征，常因查体后被人发现，因此，绝大部分亚临床甲减无需处理。对于甲减症患者来说，可以选择药物进行辅助治疗，比如使用左甲腺素钠或者右甲素，这都能够取得较好疗效。但若伴有较严重的甲减症状如乏力、便秘等，且Tsh大于10毫国际单位每升，病人再次合并动脉硬化，血脂异常和甲状腺相关抗体升高的问题，需要处理。因此，亚临床甲减和甲减都应该进行治疗，而不能简单地把二者对立起来。
一般情况下，轻微甲减可通过日常护理、使用药物等措施进行治疗，具体内容如下：
甲减的治疗方法是以甲状腺激素代替疗法为主，优甲乐和甲状腺激素篇是比较常见的药物。首先是低剂量，然后是通过全身的表现和化验的结果，逐步增加，直至所有的病症都没有了，t3、t4、ft3、tsh都会回复到原来的水平。从那以后可能也需继续服用，避免随意中断，不然1-3个可能就会有复发的情况。日常生活中要多吃些低脂肪食物，多补充碘。
甲状腺机能低下是临床上比较多见的一种疾病，其病因很多，包括先天性或后天获得性免疫缺陷性疾病以及某些慢性内分泌紊乱等引起。
甲状腺功能减退等，以原发性甲减最为多见，其治疗主要是甲状腺激素制剂的终身替代治疗，通常用左甲状腺素片治疗，即所谓优甲乐口服，视病人病情轻重而定，选用不同用量，终身替代甲状腺激素治疗期间，建议经常到内分泌科门诊进行甲状腺功能的测试。
对于单纯甲状腺肿引起的甲状腺功能减退，可靠而适宜的补碘治疗。因为人们自己分泌这种东西，只是因为分泌的太少，所以需要补充一点，只要定期监测甲状腺功能在正常范围内。
甲减可服用药物治疗，甲状腺激素药物与人体甲状腺分泌的甲状腺素结构相同，服用后不会影响机体功能，对肝肾功能无不良影响，可以长期服用。甲减开始治疗后，应每个月检查一次甲状腺功能，及时调整用药剂量，以长期维持治疗。