甲状腺结节患者可以口服甲状腺制剂，如左甲状腺素钠、甲状腺片，可以搭配碘制剂一起服用。中药对该病也有显著疗效，如五海瘿瘤丸、海藻昆布汤等，可以帮助缓解不适症状，具体用药需遵医嘱使用。
当患者出现压迫气管、食管等症状时，应及时进行甲状腺切除手术治疗。如果有继发功能亢进、恶性病变等情况，可以选择手术治疗，最好是通过穿刺或活检等方法对甲状腺结节组织进行病理检查，以明确是否有恶性病变，防止病情恶化。
亚急性甲状腺炎可以用药物治疗。
常用抗炎镇痛药物及糖皮质激素类药物；此外还需要对症治疗，主要针对甲状腺功能亢进期及加减期出现的症状进行治疗。疼痛症状明显者，以对症治疗、抗炎镇痛为主，一般采用非甾体类抗炎药控制症状。使用非甾体类抗炎药后，颈痛症状无明显缓解，同时伴发热，需用糖皮质激素治疗。激素治疗也不能缩短其病程，症状好转后可减重停药到底。
甲状腺眼病的治疗包括一般治疗、药物治疗和手术治疗，具体如下：
1、一般治疗主要包括戒烟，限钠盐，白天戴有色眼镜护眼，可使用人工泪液。睡眠中闭不上眼皮时，患者用纱布遮住眼睛或戴眼罩。
2、中重度活动性Graves病眼病患者，可使用糖皮质激素治疗。糖皮质激素具有抑制免疫反应和抗炎的作用，是活动期间严重甲状腺眼病的一线用药。眼眶放疗可抑制眼眶成纤维细胞活动，减少淋巴细胞生成细胞因子，与糖皮质激素联合使用比单独使用、放疗或激素更有效。
3，手术治疗主要有鼻内镜眶内减压术、眼外肌手术、眼睑手术治疗。
不同性质甲状腺结节的治疗方法不同，具体如下：
1、一般治疗：体检发现甲状腺结节较多，不少患者为是否需要治疗而烦恼。大部分的甲状腺结节呈良性，增大不是较快，可能一辈子对健康没有影响，此类结节则不需要治疗，定期随访即可；
2、微创治疗：甲状腺结节逐渐增大，可选择微创治疗，即消融治疗，达到良好的控制目的；
3，手术治疗：恶性甲状腺结节，需采用手术方法治疗。
亚急性甲状腺炎为病毒感染相关疾病，其病程具有自限性，预后良好。
亚急性甲状腺炎以止痛对症为主，首先，病人可出现颈前区明显疼痛，此时，患者为他服用了非甾体消炎止痛药来缓解疼痛，如收效甚微，也可在短期内用激素缓解疼痛。如果亚急性甲状腺功能亢进症或者亚临床甲亢都可以在服用降糖药之后再进行手术治疗。若亚急性甲状腺炎正处于甲状腺毒症期，病人出现心悸等显著高代谢症状，β受体阻断药可在短时间内应用。如果亚急性甲状腺机能亢进症处于亚临床期则应该在急性期和缓解期交替进行用药。如亚急性甲状腺炎正处于甲减期，此时可短期用小剂量优甲乐代替治疗。对于已经出现甲亢或者亚临床甲亢的病人来说，应该及时服用抗甲状腺抗体抑制剂以及硫唑嘌呤类药物。但是，这类药物均无需长期服用，亚甲炎的预后良好，病人不必过分忧虑。如果是亚临床型的甲亢，则建议使用硫唑嘌呤联合二甲双胍或者硫唑核苷进行治疗。上述计划仅供参考，具体的用药请根据自己的病情，在专业医生的指导下进行。
桥本氏甲状腺炎目前尚无特异性治疗手段，大多数病人无需处理，诊断后可定期追踪观察。
桥本氏甲状腺炎属于自身免疫性甲状腺炎的一种，因自身免疫功能紊乱所致甲状腺疾病，它是遗传因素与环境因素相互作用的结果，临床上以大面积免疫紊乱为主要特征。存在临床型及亚临床型的甲减，以甲状腺功能下降为主采用甲状腺激素替代治疗，老年患者或慢性心功能不全者，应适当减量。目前尚无特效药物或根治药物，一般采取对症处理。桥本氏甲状腺炎的外科治疗较少，如压迫症状较重，或用甲状腺激素代用后，甲状腺仍有明显增大的患者，可考虑手术治疗。