甲状腺突眼的治疗选择局部有一些滴眼液结合临床，选择合适的药物，还需要注意积极治疗甲状腺疾病，如甲亢等，严格遵医嘱，选择合适的药物进行治疗，定期进行复查随诊，调整用药剂量。
甲状腺不治疗一般是不会好的。如果不治疗会使全身各器官都会受到影响，功能衰竭，全身营养不良，所以检查甲状腺突眼药及时的进行治疗，治疗期间要听从医生的，这样效果会比较好。
甲状腺突眼头晕呕吐可以服用治疗甲亢的激素药物或者舒肝和胃的中药，使眼球后纤维化的变性组织逐渐恢复，应根据具体的复诊结果来修改药量。尽量不吃生、冷、油腻等不易消化的食物，少食多餐。
亚急性甲状腺炎可能引起病人突眼。
由于亚急性甲状腺炎最初，会有一种甲状腺功能亢进之类的症状，以及甲状腺功能亢进症，可使病人有一甲亢性突眼。对于一些良性或恶性的甲状腺结节而言，如果出现明显的肿大或者钙化等情况时，就应该及时就医诊治，否则可能会导致严重的后果。亚急性甲状腺炎引起患者甲亢突眼几率相对较小，主要病因亚急性甲状腺炎其为自愈性。一般认为，如果患者在没有发生甲亢之前，就已经存在着这种现象的话，那么这个亚急性甲状腺炎并不能引起患者产生突眼的问题。即多数亚急性甲状腺炎，无须采取任何医疗干预手段，还可以恢复正常，因此，亚急性甲状腺炎引起甲亢突眼可能性相对较小。一般情况下，亚急性甲状腺炎引起突眼，并没有明显的症状和体征，并且在短时间内就能消失，这一点对于医生来说很容易诊断出来。但并不代表亚急性甲状腺炎患者有甲亢症状，不发生突眼，因此还有部分病人可发生突眼。
突眼性甲状腺肿，是患有甲状腺肿胀大同时伴有甲亢的症状。由于甲状腺激素分泌异常增多而引起的症状，患者会出现视力模糊、眼部干涩、疼痛，出现眼突等症状。患者应尽早进行干预治疗，症状较轻的可以外用滴眼液，患者应按时服用治疗甲亢的药物。
甲状腺突眼的具体机制尚不明确，考虑与自身免疫有关。球后组织具有和甲状腺组织一样的抗原成分，同样受到TRAb的刺激作用，导致球后组织充血肿胀，纤维增生，细胞浸润等，导致眼球外凸。