宫颈囊肿为慢性宫颈炎之一种表现形式，无明显临床症状，一般无需处理，通过观察就可以，如合并宫颈糜烂、白带异常、腹痛等症状，感染和其他状况需及时处理。通常临床上宫颈囊肿主要有药物、手术和物理治疗。其中以药物治疗为主，主要采用抗生素或抗菌药物进行局部注射和口服用药，但这些药物有很多不良反应，如过敏反应，胃肠道反应等。因此选择安全有效的药物成为了当务之急。物理治疗是当前公认的较佳治疗手段，主要有微波、激光和冷冻等，电熨和其他治疗对更大凸出宫颈表面囊肿，电刀切除治疗是可以考虑的。
宫颈囊肿不是药物治疗的范围，颈囊肿是慢性宫颈炎症的一种，在慢性子宫颈炎时，子宫颈腺体及周围组织都增生。当腺管被周围组织所挤压，腺口阻塞，使腺体内的分泌物不能外流而潴留于内，致腺腔扩张，形成大小不等的囊形肿物。可以做微波电熨leep等治疗。
宫颈囊肿一般发生在宫颈炎愈合的过程中。可通过妇科检查，宫颈细胞学检查，宫颈活检，B超检查，阴道镜检查等明确病情。宫颈细胞学检查可排除宫颈病变甚至宫颈癌前病变。
对于少量的有轻微阴道感染的宫颈囊肿的治疗，一般进行阴道清洗，或者是阴道局部的塞药，避免逆行感染，对于超过3公分的宫颈囊肿，一般采用手术治疗，除了常规治疗之外，还可以选择微波、激光、冷冻、电熨等。
一般来说，宫颈囊肿属于慢性宫颈炎的一种，主要是宫颈表面腺体开口阻塞引起的。如果是单发的小囊肿，而且宫颈脱落细胞学检查无异常改变，通常随诊观察即可，一般不用治疗。如果是宫颈表面多发囊肿，而且有宫颈糜烂，可能会引发腰骶部坠痛、黄脓性白带等症状，一般要治疗。可以遵医嘱选择射频消融术或者是利普刀治疗。术后一个月内通常禁止性生活。