治疗病毒疣，首先应根据病毒疣生长在哪里，疣体有多大，有多大等情况，制订治疗方案。
通常可外用氟尿嘧啶软膏治疗、咪喹莫特膏、干扰素软膏，酞丁胺擦剂治疗，如有需要，也可将疣体刮除，再用碘伏、医用酒精消毒，能够有效的改善病症，在治疗期间要注意多休息，有助于病情恢复。
通常病毒疣可以根治。
就寻常疣而言，可以用冰冻、雷射、电离子来进行。出现大范围的皮肤炎症时，可以给予免疫调节剂，例如：干扰素、卡介菌多糖核酸注射液等，还可以服用转移因子胶囊。还有就是传染性软疣，通常只要进行有效的刮疣就可以了，一般可达到较好的治疗效果。
疣体脱落消失，不再有新的病毒疣体生长一般才算好了。
病毒疣一旦痊愈，就会出现脱屑、脱落、甚至消失的症状。如果病毒疣在经过几个星期、几个月的时间里，又长出了新的疣体，并且HPV-DNA检测结果显示，表示病毒疣还没有完全根除。
建议患者在治疗期间勤洗澡、勤换衣。
使用冷冻法治疗尖锐湿疣症状的时候，如果有疼痛的情况出现的情况下，也可以使用止疼药物来进行治疗。另外在治疗的时候要避免有性生活的情况出现，要注意把贴身的衣物做消毒处理，清淡饮食，避免吃辛辣刺激食物。
病毒疣这个一般会感染人类的皮肤和表层黏膜。有高度的特异性，生长在生殖器官附近皮肤和黏膜上的人类寻常疣、尖锐湿疣以及生长在黏膜上的乳头状瘤。病毒疣一般只能对症治疗，激光冷冻治疗即可，主要是要提高免疫力，因为这个是病毒感染，只有靠免疫力将病毒打败才是最根本的方法。
