治疗包括病因治疗和对症处理两方面。已明确病因者，应尽早采取措施，去除病因。如抗感染、清除进入体内的毒物、颅内占位病变的去除、补充缺乏的维生素和营养物质等。病因已不存在或无法去除者，则宜采取有效措施，维持正常生理功能，消除精神障碍。急性器质性精神障碍的病人，常有精神运动性兴奋，可口服药物镇静，也可加用肌肉注射。由于镇静作用较强，可引起体位性低血压，所以对年老、血压偏低或有呼吸功能衰竭的病人应慎用。
应激性精神障碍是指患者受到强烈刺激后出现多组精神症状的一种精神疾病。有可能出现精神病性症状，也有可能出现焦虑抑郁症状，躁狂状态，也有可能出现意识障碍，不能认识人，癔病样发作等。
精神障碍指大脑机能活动发生紊乱，造成中枢神经系统功能失调，导致认知、情感、意志和行为等各种精神活动异常。病因主要有先天遗传、个性特征及体质因素、器质因素、社会性环境因素等。表现为妄想、幻觉、错觉、情感障碍、哭笑无常、行为怪异、意志减退等。
可以口服调节神经的药物来治疗，器质性精神障碍，首先要积极治疗导致精神症状的器质性病因，在进行相应的病因疗法后，症状就可得到缓解。也要对症治疗症状。因为精神症状的存在，会影响躯体疾病的治疗。
精神障碍是一类具有诊断意义的精神方面的问题，以认知，行为等方面改变，常伴有功能损害。精神障碍包括器质性精神障碍和非器质性精神障碍，如抑郁症经过积极的干预，大部分都能够完全恢复正常，甚至不再复发。
对兴奋躁动并确诊为非颅内出血所致者，在密切观察瞳孔与意识状态情况下，予以小剂量抗精神病药或抗焦虑药。脑外伤后综合征与神经症采用相应神经症的治疗，恐惧与抑郁可选用三环类抗抑郁药治疗，脑外伤后精神病可选用抗精神病药治疗。