多见于泌尿生殖道感染（如：支原体、衣原体、淋菌、G+球菌、G-杆菌等）、先天性睾丸发育不全、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、慢性中毒、营养不良、精神过度紧张、性交过频、精索静脉曲张等以上疾病均可影响精子的发生过程。
导致精子畸形率高的原因很多，酗酒、吸烟会导致精子畸形，泌尿生殖系统感染，是造成精子畸形的一个主要的原因，内分泌紊乱，化学制剂、环境污染以及辐射等因素，都很可能会造成精子畸形的发生。
造成精子畸形的原因有：不良的生活习惯，生殖泌尿感染，也是造成畸形精子症的重要原因之一，男科疾病也是造成精子畸形率过高的一个原因，香烟当中的尼古丁以及白酒当中的酒精，染色体发生变异，导致精子畸形的发生，内分泌功能低下，即体内某些相关激素的分泌不平衡，从而造成畸形率增高。
精子畸形的原因很多，有先天性的，也有附睾炎、前列腺炎、精索静脉曲张导致的，还有酗酒、吸烟会导致精子畸形，泌尿生殖系统感染也是导致畸形的一个重要原因，可以到医院生殖科或是男性科就诊，查明自身原因后针对性治疗。
吸烟时间越长，精子畸形的数目就会越来越多。如果是身体内有的相关激素的分泌不调，就会导致畸形率的上升。由于存在泌尿生殖感染疾病，精液中的营养物质就会大大的减少，导致精子发生畸形或是直接死亡。