亚急性甲状腺炎治疗方法应结合患者的具体情况而定，并且患者病情存在个体化的状况，并非所有病人所呈现之症状均一致。
要选择合适的药物来进行辅助治疗，这样才能更好地提高疗效，减少不良反应的发生几率。许多病人就是反应不一样，例如，有些病人颈部疼痛非常明显，部分病人颈部疼痛较轻，但当颈部疼痛显著时或较轻颈部疼痛时均需优先选用非甾体抗炎药进行止疼、消炎治疗，只有当非甾体类抗炎药不能控制病人颈部疼痛的情况时，才能考虑适当增加激素治疗。
亚急性甲状腺炎一般的疗程1~3个月。
亚急性甲状腺炎是一种病毒感染性甲状腺炎症性病变。亚急性甲状腺炎主要表现为甲状腺疼痛，可伴有发热、乏力、肌肉酸痛等全身不适症状。少数患者病情较慢，一般半年至一年左右就能恢复。如果患者抵抗力较强，病情较轻，病程较短，如果患者一般情况较差，年龄较大，恢复较慢，病程较长。建议患者积极地配合医生进行治疗。
甲状腺炎的治疗通常经内科保守治疗即可，治疗费用的高低，主要取决于疾病和病人临床表现。
部分较轻之甲状腺炎，例如，较轻者桥本氏甲状腺炎，通常无需特殊处理，仅需常规复查甲状腺功能或甲状腺超声。若为较严重甲状腺炎，由于病人临床表现较严重，因此，在处理上也有较多措施，而病情严重的人，也许会在花费上付出更多的。另外还有一种情况就是严重程度比较高，并且伴有全身症状的疾病，这类疾病通常需要通过手术进行治疗，但是这种情况下耗费时间长，费用较高。由于治疗期间需经常检查和复查，依据检查结果，对治疗方案进行调整，因此，耗费的成本可能会更高。还有就是对于部分症状较轻微的甲状腺炎，没有什么特殊情况的话，不用太担心，但是有些严重的则必须考虑到手术问题了。甚至有些甲状腺炎还相当严重，需配合外科手术治疗，则耗费可能稍多。另外对于不同类型的甲状腺疾病来说，其具体治疗方式和效果都存在一定的差别。因此，甲状腺炎治疗费用的高低，主要取决于疾病和病人临床表现，不同的疾病，耗费的费用就不同。
可以用激素进行治疗，通过激素治疗应该是可以达到控制临床症状的目的。如果患有亚急性甲状腺炎，主要的治疗方法就是可以通过应用，非甾体类的抗炎药或者是糖皮质激素进行治疗，同时对症用药进行处理，都是可以完全恢复的。
亚急性甲状腺炎如果症状轻只需口服药物治疗即可，如果症状重颈部疼痛发热明显，就需要激素治疗，一般需要2周以上可以考虑减药。减药应慢，减药快易复发，需要在医生指导下根据辅助检查用药。
急性甲状腺炎可以通过药物、手术等方式进行治疗。
急性甲状腺炎的治疗原则是：抗感染和手术介入，在早期确诊后，首先要选择广谱抗生素进行经验治疗，等穿刺物病原体的培养有了效果，再进行抗生素的调整。一般来说，如果合并有一些基本的疾病或者先天性畸形，很难控制感染，需要在2-3个星期内使用抗生素，在脓肿形成后进行抗感染治疗，同时还要进行排脓。