子宫内膜异位症的治疗要根据患者的年龄、病情的严重程度、是否有生育需求来决定，具体的治疗方法有：
1、保守治疗：可以采用假孕术或假绝经治疗，在子宫中用药来控制女性的经期，从而达到假孕或者绝经的目的。
2、外科：现在采用的是微创技术，即腹腔镜，对病变进行全面的综合、根治性和半根治性的治疗，提高患者生存期、生活质量、怀孕率。
通常情况下，患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗子宫内膜异位症。具体情况分析如下：
使用药物：子宫内膜异位症患者可以口服避孕药、促性腺激素释放激素激动剂（GnRH-a）、雄激素类药物（丹那唑）、孕激素受体拮抗剂（米非司酮）等。
手术治疗：年轻且有生育要求的患者，应进行保留生育功能手术；已有子女且患者年龄较大，应进行保留卵巢功能手术。
女性出现子宫内膜异位症，大部分是因为经血流出不畅，有子宫内膜逆流入盆腔内引起的。还有一部分女性是在做完刮宫或者是人流或者分娩之后，子宫内膜发生损伤导致的。女性如果没有生育计划，要采取必要的避孕措施，避免宫腔操作，诱发子宫内膜异位症现象的出现。
如果子宫内膜异位不严重，现在可以使用活血化瘀的药物保守治疗，可以缓解大姨妈引起的疼痛。如果子宫内膜异位症严重，有明显的肿块，可以考虑手术治疗。子宫内膜异位是具有活性的子宫内膜生长在子宫以外的地方，异位的子宫内膜组织随着大姨妈周期发生变化。
剖腹产引起的子宫内膜异位症应该在剖宫产术后子宫内膜异位症可以先口服药物保守治疗。如果症状比较严重就需要手术治疗，因为剖宫产容易造成子宫内膜异位症的发生。是指有生长功能的子宫内膜在子宫腔以外的部位生长并且规律性脱落。
对晚育妇女，尤其是伴有痛经者，应尽早生育。可选择口服避孕药，即可避孕，又可减少子宫内膜异位症的发生。经期避免性生活；剖宫手术时注意保护好伤口，避免将子宫内膜带至切口内种植。人工流产时，避免突然降低负压，以防子宫内膜逆流入盆腔。有空腔操作时，要在月经干净3-7天。