现在已经有一些研究显示，硒可以改善甲亢和甲减，但这还只是处于实验阶段，目前还没有办法通过传统的硒来治疗。
甲状腺炎属于亚急性甲状腺炎、自身免疫性甲状腺炎、化脓性甲状腺炎、产后甲状腺炎等一系列疾病，属于一种总称。这种甲状腺炎是不需要补硒的，不过补充硒并不会对这些副甲状腺炎造成太大的伤害。亚急性甲状腺炎，一般都是通过疼痛来治疗，随着时间的推移，这种病就会痊愈，属于一种自我调节的病症。自身免疫性甲状腺炎是一种慢性疾病，如果在甲功正常的情况下进行治疗，一旦发展为甲减，可以选择使用优甲乐替代治疗。
亚急性甲状腺炎患者在进行治疗时，需要引起重视，亚急性甲状腺炎可表现为共同症状，分别为发热、甲状腺肿大、颈部疼痛等。这些症状都是由于甲状腺功能失调所致，要针对病人的病症对症下药。
如果亚急性甲状腺机能亢进的患者出现了这些症状，就应该及时到医院检查诊断并给予针对性的药物治疗。以及亚急性甲状腺炎病人，很可能起病时症状较轻微，不需要止疼药之类的对症治疗。而且一些病人很可能在发病时症状更加严重，就是要采取相应的措施。如果没有及时采取针对性的措施，那么病情就容易加重或者导致病情恶化。如将需止疼和减慢心率的对症支持治疗，一旦症状较重时，相应治疗时间亦随之增加。
可以口服消炎类的药物进行治疗，必要时要进行手术引流，甲状腺炎是甲状腺的炎症性疾病，可以分为急性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎和慢性甲状腺炎。急性甲状腺炎为通常为急性化脓性甲状腺炎，比较少见，表现为局部红肿、疼痛、全身畏冷发热等症状，严重者可以出现甲状腺脓肿形成。
甲状腺炎症没有治好的办法，只能针对甲状腺大小和甲状腺功能异常作对症处理。如甲状腺功能正常，甲状腺小、无明显压迫症状可随诊观察，若肿大的甲状腺压迫邻近器官或影响外观，可以服用对症药物缓解处理。
亚急性甲状腺炎治疗方法应结合患者的具体情况而定，并且患者病情存在个体化的状况，并非所有病人所呈现之症状均一致。
要选择合适的药物来进行辅助治疗，这样才能更好地提高疗效，减少不良反应的发生几率。许多病人就是反应不一样，例如，有些病人颈部疼痛非常明显，部分病人颈部疼痛较轻，但当颈部疼痛显著时或较轻颈部疼痛时均需优先选用非甾体抗炎药进行止疼、消炎治疗，只有当非甾体类抗炎药不能控制病人颈部疼痛的情况时，才能考虑适当增加激素治疗。