对于性功能障碍的治疗，首先要找出性功能障碍的类型和诱发因素。只有找到了具体的原因，才可能成为治疗的目标。由每个人不同的身体状况引起的性功能障碍的因素也是不同的，这取决于是精神疾病还是疾病。这一点必须清楚地理解。如果找不到药物，盲目使用是不好的。
在临床上，引起性功能障碍的原因有：
第一点，就是生理上的问题，当人类变老时，性机能就会慢慢衰退。
第二，是心理上的原因，此外，也存在着一定的心理和心理问题，比如说患者在做爱的过程中会很紧张，也会因为之前的性爱失败而产生不正常的行为。还有一些性机能失调，这也许是因为宗教的文化观念造成的。
第三，也有可能是由于肥胖症引起的，患有糖尿病的患者，可能会引起性功能障碍。
性功能障碍主要表现为性交障碍、性欲障碍、射精障碍、性高潮障碍等。
性功能障碍是与神经系统、心脑血管、内分泌、生殖系统等相关的复杂生理过程。该病常会出现性交障碍、性欲障碍、射精障碍、性高潮障碍等。建议及时到医院检查治疗，可以选择药物治疗、性教育、心理治疗、行为治疗等，避免对生活和身体造成伤害，平时要注意饮食卫生，饮食清淡，不要过度劳累，要有充足的营养。
性功能障碍危害会影响夫妻之间的性和谐，甚至引起家庭婚姻不幸；导致心情压抑，会失去男人的尊严，丧失男性的阳刚之美，还有可能导致不育不健康的精子和卵子所孕育出来的生命质量是不能保证的，性功能障碍时身体机能下降的结果，积极的到医院进行检查治疗。
男性出现性功能障碍可以通过口服药物、物理疗法、手术等方法进行治疗，也可以采取中西结合方法综合性治疗，男性在性生活当中不能正常勃起或者勃起硬度差，平时注意减少手淫，加强运动。
性功能障碍治疗药物有很多种，特别是阳痿，目前最常用的药物就是西地那非、他达拉非、伐地拉非，它们是选择性磷酸二酯酶5型抑制剂。
本品于性交前一小时服用，可改善男性的勃起功能，令其保持适当的勃起，并保持适当的硬度，并完成一次性交。在服用此类药物时，要避免与硝酸酯类药物合用，否则会导致严重的低血压。还可以通过在阴茎海绵中注入前列腺素E1来促进阴茎的勃起。或者，仅使用比法尔，它是一种用尿道注射的软膏，它能使阴茎迅速地勃起。局部疼痛和低血压是副作用。可以服用达泊西汀，它是一种能延长男人射精的药物。上述方法只是一个参考，具体的用法，请根据药物说明书或者到正规的医院进行用药。