肾结石的治疗需要根据结石的大小，结石的多少来决定。对于较小的肾结石，可以通过体外冲击波碎石的方法来进行治疗。体外冲击波碎石，对人体创伤较小，安全有效。可以将较小的结石打碎，从而使结石自行的排除体外。
开放性手术：兴起于80年代，是早期的肾结石手术治疗方式，常见的有肾盂切开取石、肾实质切开取石、输尿管切开取石等；微创碎石取石治疗：常见的有硬性输尿管镜碎石取石术、输尿管软镜碎石取石术、经皮肾镜碎石取石术等，是近几年较主流的手术治疗方式。
肾结石在临床上十分常见，对于较大的肾结石，一般直径在2cm以上的结石，需要采用微创手术来进行取石和碎石手术，这种手术方法被称作经皮肾镜肾结石碎石取石手术。该手术的方法是在腰部皮肤穿刺，经过皮下组织、肾实质进入肾盂内，然后用扩张鞘将通道扩张，当扩张到一定程度时，置入镜鞘，在镜鞘的帮助下把肾镜通过镜鞘送入到肾盂内，然后在镜子的直视下用激光或者用超声将结石打碎取出。
最常做的手术都是体外冲击波碎石术，一般不需要开刀，直接可以通过体外，用声波把石头打碎，打碎之后促进它的排出，还有一些如果手术处理不了的结石，可能会用到微创手术治疗。
建议患者结合自身条件加上医生的诊断，选择合适的治疗方案，可以使用体外冲击波碎石治疗肾结石，一般小于2厘米的结石容易破碎和排除，如果结石太大，可能一次就很难完全粉碎取出。建议去正规医院做全面完善的检查，根据具体情况来决定是否适合碎石手术的治疗。
建议患者日常多饮水，多食含维生素A、粗纤维、禁止食用含草酸食物，合理控制蛋白质、钙、糖盐脂肪、维生素C、D的摄入。
软镜手术应该是经输尿管软镜碎石治疗，是利用一条细软管镜，经过尿道、膀胱插入输尿管，将输尿管结石或肾脏结石击碎取出，若是结石直径超过零点六厘米就很难通过药物排石治疗了，直径在零点六至两个厘米的结石可以考虑进行体外碎石治疗。