通常来说，诊断胆结石需要做腹部CT检查、B超检查、核磁共振检查等检查。
胆结石包括胆囊和胆管的任何部位发生结石的疾病。按发生的部位来分，可分为胆囊结石、肝外胆管结石和肝内胆管结石或者上述多部位同时并发，其中胆囊结石占全部结石的50%左右。胆石病的临床表现以右上腹胆性绞痛、黄疸和发热为三大主证，其疼痛往往于夜间、饱餐后或进食高脂肪食物后发作，疼痛可向右肩或右肩胛部放射。通常可以进行腹部CT检查、B超检查、核磁共振检查等检查。
肾结石的诊断依据通常是症状结合检查结果，具体分析如下：
1、根据病史和临床表现，如果病人突然有单侧或双侧的突发性腰痛，进行性加重，同时伴有排尿不适、肉眼血尿等，需要考虑有没有肾结石。
2、需要进一步的化验，尿常规中有大量的红细胞，需要考虑有没有肾结石。
3、需要做影像学检查，一般需要做泌尿系统B超检查，如果肾中出现了声影高密度影，提示肾结石。如果B超无法分辨，建议做肾CT检查。CT能清楚地反映结石的位置、大小和分布。
通常根据上述三个方面来判断是否有肾结石。
可以住医院坐B超检查确定结石的大小及部位，服用利尿排石的中药及消炎的西药，每天喝2000毫升以上的水，多做跳绳等跳跃运动，坚持三个月后可以做B超复查结石的大小，如果变小了就坚持保守治疗，如果期间有肾结石引起的绞痛，就考虑做体外碎石或手术切开取石治疗。
结石大致分为胆囊结石和肾结石，慢性期结石无明显症状，急性发作期可表现多种不适，比如胆囊结石急性发作时除上腹部疼痛外，还有恶心、呕吐、发热、厌油腻、腹胀等症状，部分还会出现身体皮肤发黄的情况。肾结石常常伴有肾区叩击痛，剧烈绞痛，血尿，面色苍白，严重时可有头晕、血压下降以及恶心、呕吐、腹胀等消化系统症状。
睾丸微结石有不育的可能，不育症是因为睾丸结石的位置是“弯曲的精小管”，精小管是精子运输的通道。这不仅会导致低生育率，还会导致男性不育，睾丸微结石一般继发于泌尿系结石，由前列腺、精囊、附睾结石等蔓延发病。睾丸结石使睾丸结构遭到破坏，生精细胞受损，影响男性激素的分泌功能。
对于输尿管结石的治疗原则是小于5毫米的不需要特殊治疗，可以自己排出；大于5毫米小于2厘米的可以做体外碎石治疗。大于2厘米的需要手术治疗。患者可以根据超声显示的结石大小进行治疗。同时多喝水，应用消炎药预防感染。