早期的宫颈囊肿治疗方法包括冷冻、激光、微波等。除了传统的物理疗法，女性也可以选择使用微创疗法进行治疗。在使用物理疗法治疗疾病时，女性也可以选择使用药物进行辅助，这样治疗效果会比单纯的使用物理疗法或者是药物治疗效果更明显。
无症状可以观察，定期宫颈刮片（TCT）；或者用针刺破，涂以碘伏；伴发炎则予以抗感染治疗；也可物理治疗，如微波、激光、冷冻、电熨等。如不伴发其他情况，建议注意外阴的清洁卫生，避免炎症感染。
一般来说，宫颈囊肿是一种慢性宫颈炎，要根据自身的情况来选择治疗。
1、体积小于1cm的单发宫颈囊肿，若为出现不适症状，可以先不用治疗。
2、宫颈囊肿体积大于1cm，可以选择钳夹、电灼、冰冻等方法治疗。
如果出现宫颈囊肿，伴随白带量增加、白带发黄、异味等症状，可以口服消炎药物进行抗感染。宫颈囊肿有可能合并宫颈息肉、宫颈糜烂等宫颈炎综合征，患者可以通过波姆光、超声聚焦等方式进行治疗。
宫颈囊肿的治疗方法是因人而异的，病情不同，治疗的方法也会存在一定的差异。在临床中治疗宫颈囊肿的方法包括药物治疗、传统妇科手术治疗以及物理疗法，而物理疗法是当前备受医患青睐的一种治疗技术，女性朋友治疗宫颈囊肿要根据自己的病情和建议进行科学治疗，切莫盲目跟风，以免影响疾病之治疗的效果。平时应注意个人卫生，注意锻炼身体，适当注意营养卫生，保障身心健康，保持外阴清洁，防止病原体侵入引起发病。
初期宫颈囊肿可以采取药物疗法。宫颈囊肿同宫颈糜烂、宫颈息肉一样，是慢性宫颈炎的一种表现。平时要注意锻炼身体，适当注意营养卫生，保障身心健康；实行计划生育，采取避孕措施，尽量避免多次人流对宫颈的机械性损伤。
早期的宫颈囊肿是能治好的，治疗需要看严重程度，如果没有不适症状，囊肿较小，定期复查就可以，如果囊肿较大，或者伴有少量出血，一般建议手术，要进一步做宫颈癌的筛查。