通常存在于唾液腺开口处的牙齿表面，下颚前牙的舌侧表面，上颚后牙的颊侧表面和牙齿的颈部，以及口腔、口腔黏膜运动不到的牙齿表面等处。牙结石开始是乳白色的软垢，会因逐渐的钙化而变硬。牙结石是牙周病发展的一个重要致病因素，不注意养成良好的口腔卫生习惯，即使彻底洁治后，牙结石很容易再次沉积在牙齿表面。
在吃完饭以后两小时左右，在牙颈部会形成获得性薄膜，然后会有口腔内的细菌附着在薄膜上，慢慢的细菌分泌因子，使得细菌附着在薄膜上更加牢固，细菌周围还有食物残渣，随着时间的推移，在软垢上会有钙离子沉积，慢慢的就形成了牙结石。
牙结石的形成是由多方面的因素如化学物质、酶、菌斑等综合作用的结果。它以菌斑为其基质，在菌斑表面，因唾液中的矿物盐沉积，食物残渣及坏死脱落细胞的参与，菌斑形成的第2—14天即可钙化，变硬而形成结石。
清理牙结石是没有危害的。牙结石是一种附着在牙齿表面上的矿化沉积物，非常坚硬，与牙齿紧密结合，患者自己没有办法去除。如果自己清理牙结石，比如用力抠掉或者磨掉，会对牙齿、牙龈组织造成损伤，甚至会导致牙齿松动、脱落或者感染。
牙结石的危害是牙石不断刺激牙周组织，压迫牙龈，影响血液循环，造成牙周组织的病菌感染，引起牙龈发炎萎缩形成牙周袋，更易使食物残渣，牙菌斑和牙结石等的堆积，破坏牙周膜，损伤牙齿。
牙结石产生由于唾液中的二氧化碳浓度降低，促使无机盐沉淀于牙齿表面上。还有可能是由于退化细胞的磷酸盐酵素，使有机磷水解产生磷沉淀于牙齿表面而形成。其次是细菌使唾液的酸碱值升高而呈碱性，造成唾液中的蛋白质分解，放出钙盐，沉淀于牙齿表面上而成。