采取龈上洁治术、龈下刮治术、根面平整术以及牙周手术，需要将牙结石彻底的清理干净。在牙周袋内如果有牙结石，需要采取刮治的办法将结石清理掉，并且在局部进行消炎。一般当牙结石彻底清除掉之后，炎症会慢慢的恢复，牙龈组织与牙之间的关系会恢复正常。
问题分析：从您描述的情况来看，这个考虑是有炎症了，需要使用一些消炎抗菌清热解毒的药物。
指导建议：可以口服人工牛黄甲硝唑，头孢克肟等药物消炎治疗一周左右，这段时间注意休息，饮食清淡，喝温开水，少喝饮料，忌辛辣，忌烟酒。
舌头的左边缘有疼痛的症状，主要有以下几种：
1、叶状乳头炎：叶状乳头在舌侧边缘的后方，在一定的时间内，由于长期的慢性刺激，会引起叶状乳头炎，引起舌侧边缘的疼痛；
2、舌侧缘粘膜损害：可导致舌侧缘粘膜损害，如牙齿特别是下颚的边缘锋利，或有残根、残冠、修复体不良、有较大的粗糙牙石等。长期的伤害会导致舌侧边缘的疼痛，从而导致创伤性溃疡；
3、反复性阿弗他溃疡：目前尚无定论，多数学者认为其与免疫、遗传、全身溃疡、感染等因素相关，也有与地理、工作环境、人文环境、维生素、微量元素缺乏、游离基等因素相关。
舌侧缘疼痛要及时去医院口腔科了解原因，并针对具体的原因采取相应的治疗措施。
牙齿矫正一般是不容易导致牙龈萎缩的，所以不需要过度担心。牙齿矫正主要是针对牙齿畸形来做治疗的，目前的矫正方法主要包括了钢丝牙套矫正和隐形牙套矫正，属于一种安全性比较高的治疗措施，所以不会造成牙龈萎缩的状态。牙龈萎缩主要是由于牙龈长时间受到慢性炎症感染所造成的。在矫正牙齿期间需要定期到医院做检查，及时了解牙龈是否出现了炎症性的病变，同时还需要注意口腔的卫生和清洁。
一般可以吃一些清淡容易消化的食物对牙齿和牙龈好，能够达到很好的矫正效果。如果有牙齿排列不整体的情况，通常可以到正规医院的口腔科，通过佩戴隐形牙套等方式来矫正，在佩戴牙套期间一定要注意个人的饮食，可以吃富含蛋白质和维生素的食物，但是不要吃过硬的食物，否则就有可能会影响到矫正牙齿的效果。
下牙最里边牙齿旁边的肉又肿又疼考虑是智齿冠周炎，应用消炎药如相关药物消炎，炎症消退后，可以到医院找口腔科大夫看看，可能需要拍片，看看牙齿牙根的情况，情况对症处理。可能需要拔除智齿，以免后患。