肛门瘙痒的患者在治疗上可以采取清热利湿、活血祛风、止痒的药物帮助治疗，可以选择外洗和药膏，来缓解瘙痒症状；存在虫卵感染引起的，应该考虑是否有蛲虫感染的现象，采取驱虫的药物帮助治疗。
直接镜检：镜下可见成群的卵圆形孢子和假菌丝，如找到较多的假菌丝时，说明念珠菌处于致病阶段。分离培养：可见大量乳白色菌落生长，用接种针挑取少量菌落涂片，直接镜检或染色后镜检，可见大量芽孢子，可初步诊断为念珠菌感染。
瘙痒的起因有风疹，过敏，一些感染都可以引起瘙痒的症状，需要了解病情才可以对症下药。过敏的瘙痒可以服用抗过敏的药物，如果是感染引起的瘙痒，我们可以抗菌治疗，注意保持清洁，多饮水，忌辛辣食物。
包皮发痒很有可能是感染炎症所导致的，比如包皮炎或者是龟头炎，都有可能会出现瘙痒，可以口服消炎之类的药物来进行治疗。同时也要注意生殖器的卫生，要经常清洗，内裤要选择棉线类比较柔软透气的。
肛门瘙痒是肛肠科比较常见的一个临床综合征，引起肛门瘙痒的疾病有内痔，肛裂，肛瘘，直肠粘膜松弛，由于这些疾病，分泌一些粘液，长期的刺激肛门周围的皮肤，引起肛门周围皮肤变性，从而引起肛门的瘙痒。