囊胚移植后休息三天左右，刚做完囊胚移植后，需要在晚上尽早休息，而且不可以做太劳碌的事情。在一个星期之内都不可以洗澡，但是如果有温开水也可以洗外阴部位。吃的东西主要是以清淡的口味为准，在长生活中保持心情的稳定，有利于身体的恢复。
移植两个囊胚的有危险，选择移植两个囊胚，也可以在怀孕后确定孕囊个数后多胎妊娠的情况下选择减胎。减胎有增加流产宫内感染等风险。而且单囊胚移植本身就可以达到移植两个三天胚胎的成功率，双胎风险差不多。
囊胚本身的着床能力较强，移植两个囊胚，会增加多胎妊娠的风险，提高流产率，很容易早产。移植两个囊胚，会增加怀双胞胎的几率，但很容易发生妊娠综合症，增加危险性，单个囊胚发生流产几率比较小。
囊胚移植的成功率，平均水平大约在50%，而卵裂期胚胎的移植成功率大约在40%左右。囊胚移植的妊娠率比卵裂期胚胎的移植高一些，原因是多方面的，单从胚胎自身的角度来讲，能够养成囊胚的胚胎，胚胎发育潜能比较好，从第三天到培养至第5-7天，会有一部分胚胎的发生停止发育。
囊胚移植着床率比正常胚胎高，因为囊胚等级比较好，发育快。但不代表这就一定会着床，在子宫里可能会存活，毕竟子宫才是胚胎的生存，扎根环境。那么移植俩个囊胚，俩个是否着床只是说几率一样，但怀单胎几率会比俩个都着床几率高。
正常的体内受精后的7天左右就会着床，囊胚移植一般会在三到七天进行着床的，但是每个人也会存在个体差异，时间上有所不同。囊胚移植成功与否与受精卵的质量好坏有着直接关系，另外与女性的子宫环境也有关系。