一般可以使用抗甲状腺药物治疗和碘放射治疗的方法。药物治疗是治疗甲状腺增大的基础。也可以使用碘放射治疗，主要通过破坏甲状腺组织来减少甲状腺激素的产生。
甲状腺炎临床上可分为如下几类：一是亚急性甲状腺炎，其治疗主要根据亚甲炎所致临床症状进行对症治疗。
通常未给予甲状腺激素或抗甲状腺药物治疗，通常不予使用，但亚甲炎留下永久性甲减可使用激素代替治疗者除外。还有桥本氏甲状腺炎就是针对甲状腺肿大病情和甲功而拟定的治疗方案，病情较轻者可暂不治疗。
产后和无痛性甲腺炎的治疗同样以症状为主，通常不使用抗甲状腺药物，由于这两类疾病基本都属自身自限性疾病的范畴，可随时间推移而改善。
一般来说，甲状腺结节早期的治疗方法如下：
针对良性的结节，通常无需特别治疗，保持半年一次复查即可。针对甲状腺结节所引发的恶性病变，早发现、早诊断、早治疗是治疗的基本原则，除了采取手术的方法治疗外，还可以通过放疗或化疗的方法进行治疗。
甲状腺结节患者，要注意调整饮食结构，保证低盐、低脂饮食，少食碘含量丰富的食物，适当运动，如慢跑、游泳等，早睡早起，注意多休息。
甲状腺炎有较多种类，其症状及治疗方法存在一定差异。
甲状腺炎是一种多因素引起的一种异质性病变，可以将其划分为桥本甲状腺炎、亚急性甲状腺炎、无痛性甲状腺炎等疾病。桥本甲状腺炎、无痛性甲状腺炎通常表现为反应迟缓、疲倦、记忆力下降等。而亚急性甲状腺炎患者有可能表现为颈部、耳颞部出现辐射样疼痛，还可能伴有发烧的症状。在治疗时，多采用药物来调节甲状腺功能，以控制病情进展。如果甲状腺炎引起了明显的疼痛症状，可以选择服用非甾体抗炎药；如果出现心悸的情况，可以通过降低心率等药物来进行治疗。此外，患者要定期做甲状腺功能的检查，以明确自身情况。
甲状腺功能低下患者需要通过药物治疗，同时还需要服用一定数量的甲状腺激素。
在饮食上，摄入适量的碘，避免食用易引起甲状腺肿大的食品，以确保蛋白质供应，并改善和矫正甲状腺机能。
甲状腺功能减退症患者要多休息，避免过度紧张、劳累，饮食要高蛋白、高热量食物，同时要进行抗贫血的治疗，补充铁剂、叶酸、维生素B12等。
通常情况下，产后甲状腺炎治疗方法有药物治疗。
甲功七项及甲状腺超声检查可以了解甲状腺炎的主要病因。如果是由病毒感染引起的急性和亚急性甲状腺炎，可以口服抗病毒口服液，病毒唑等，同时还可以联合吲哚美辛或者布洛芬消炎、消肿等。对于亚急性自身免疫性甲状腺炎，可以选择使用强的松。如果是慢性甲状腺炎合并甲状腺功能低下，可以口服左甲状腺素片等，如果没有甲减，可以暂时不用药。此外，产后甲状腺炎一般不会出现明显的临床表现，可以先观察。
