灰指甲实际上是甲癣，治疗甲癣的方法有外用药和口服药两种方法。外治法上首先是选用各种抗真菌之类的外用药膏，内治法可口服抗真菌之类的药物，但是这类药物副作用较大，要经过判定是否能够选用，而且在治疗过程中还需要监测可能发生的副作用。
灰指甲又称之为甲癣，是由于手部的长期慢性真菌感染，逐渐累及到指甲后引起的甲板损害。治疗主要是分为外用和口服两个方面，首先可以外用一些含有高浓度尿素或苯甲酸类的药物软膏，涂抹在甲板表面，并及时的去除增厚的甲板；口服药物方面主要是在专业医生的指导下长疗程口服特比萘芬，同时应注意定期复查肝功能，以免造成肝脏损伤。
灰指甲临床上治疗主要是通过一些抗真菌的药物。同时具有一定的传染性，所以一定要注意做好保养。灰指甲这种就叫做甲癣，在临床上属于一种真菌感染性的疾病，因为属于是真菌感染疾病，难以治好，容易复发。
灰指甲属于真菌感染，容易传到另外的指甲上，治疗上采取抗真菌治疗，夏天可用冰醋酸浸泡，冬天可用软膏涂抹。平时尽量避免接触感染源，要多注意身体休息，尽量减少体力消耗。
灰指甲，是由真菌感染造成的。治疗办法是：口服抗真菌类的药物进行灭真菌治疗。在药物选择方面，可根据年龄以及其肝肾功情况、感染灰指甲的真菌种类进行选择。如果没有行真菌培养，可以选择抗菌谱比较广的药物，如伊曲康唑胶囊来抗真菌治疗，或行冲剂疗法，服用1星期停3个星期，一共进行3-4个月。在治疗同时，每个月监测一次肝功，因为抗真菌的药物会对肝脏有一定的损伤。
手术拔甲适于单发的指甲，这种方法创面大，出血，易引起感染。手术后一般会感觉较疼痛，容易感染复发，临床现已较少使用。内服药物适于多个指(趾)甲。可用于60%以上的甲癣及甲真菌病。用药量大，用药时间长，应定期监测药物不良反应。外用疗法根据药剂不同，主要局部涂药和封包削治等方法。涂药前若先将病甲削薄，疗效更佳。涂甲之前注意用温和药膏保护甲周的皮肤。选用涂剂等抗真菌外用药局部涂抹。