在早期乳管开始扩张时，有乳房胀痛，囊肿发展完成时疼痛消失。疼痛为持续性，在月经来潮前显著，月经后减轻或消失。乳腺囊肿的治疗方法，乳腺囊性病应以外科手术治疗为主，术前应明确病变部位，早期的乳腺囊肿切除为主，如有癌变则行乳房切除。
乳腺囊肿的治疗要分情况而定，如果症状较轻，不影响工作与生活时，可以用乳罩托起乳房，以缓解乳房胀痛，不用特殊治疗，可以定期到医院进行复查。如果症状较为严重时，应该及时采取手术进行切除，在手术之后，也应该做好乳房的护理，以免病情复发，可以适当的进行一些锻炼，增强自身抵抗力，可以起到病情恢复的作用。
多数乳腺囊肿无需手术治疗，乳腺单纯囊肿有自限性，经过3年或更长时间后病变可以自行停止。平时少吃油脂类食物，忌食生冷和辛辣等刺激性的食物，尽量避免使用含有雌激素的药物。
治疗乳腺囊性增生症时，可用中药或中成药调整。协调清洗和调整卵巢功能，包括疏肝理气。常用口服中药逍遥散，局限性乳腺囊性增生病，月经1至10天后复查，肿块变软缩小或消退可继续观察中药治疗。局限性乳腺增生病肿瘤必须明显区别于乳腺癌乳腺癌肿块更明显、质地硬，与周围乳腺有明显差异，有时腋窝淋巴结肿大。
根据乳腺囊性增生症的特点和临床症状，本病有无恶变可能上升，乳腺癌可能与本病同时存在，为了发现可能早期存在的乳腺癌，每2~3个月在医院复查一次。
乳腺囊肿可以采用中医中药治疗，乳腺囊肿是慢性病，内分泌失调严重，病变组织对药物敏感性差，囊肿消失就慢，所以，中药治疗口服药物至少需要半年以上才能见效，治疗时间较长。
可能有联系，也可能没有联系。具体的说，乳腺囊性增生可以出现乳腺疼痛，乳腺囊肿或结节等症状。乳腺囊肿，可以由乳腺囊性增生引起，也可以是一种独立的疾病。不过乳腺囊肿和乳腺囊性增生都是乳腺的良性病变，可以手术切除，之后每年体检复查即可。