肾积水的治疗应早期进行手术治疗，争取肾功能的较大恢复。肾积水严重，肾功能破坏十分严重，而对侧肾正常者，可做积水肾切除术。合并感染者应给予抗生素治疗。不宜过多进食富含蛋白质食物。
如果说结石比较小，这种积水比较轻，体外碎石或者口服排石药物就是它的最佳治疗方法。如果说结石比较大或者肾积水比较重，那可能手术方式就是它的最佳治疗方法。
怀孕肾积水主要是因为，子宫过大，压迫到输尿管，导致尿液无法顺利排出。
这样可引起肾积水，尤其在孕中晚期积水越来越严重，建议注意睡眠的姿势可缓解对输尿管的压迫，需要时可采取左侧卧位或交替性右侧卧位，从而使输尿管的压迫解除，梗阻的状况逐渐减轻。
胎儿降生时肾积水自然减轻，此肾积水为生理性肾积水而非病理性肾积水。如积水较重可进行双侧双截管置入以减轻排尿困难，对此种情况提示主要应严密观察。
肾积水的临床主要症状有结石疼痛、肿瘤血尿、尿道狭窄、排尿困难等。水的侧面在腰部膨大。复杂的感染包括寒战、发烧和脓尿。腰部囊性肿块在患侧。双侧慢性肾功能不全梗阻，尿毒症。腰痛腰囊性肿块。肾体积增大，皮质变薄，实质液暗区。X光静脉尿路造影显示肾积水。
肾积水会造成尿路感染、肾萎缩、结石形成、巨大肾积水、引起全身中毒、肾脏剧烈疼痛、引发高血压。长时间的肾积水得不到缓解就会发生感染症状，感染之后有脓尿和全身中毒的症状，这时候就像炎症一样会身体发热，头痛是难免的，胃肠功能紊乱也会发生，比如恶心呕吐，还可能引起结石出现，结石还会阻塞尿道并发肾积水，肾积水又诱发结石形成，肾积水得不到缓解，这两种疾病就会交替出现。这样也会引起反复的尿液感染，让肾结石的病情更加严重。建议及早到医院检查对症治疗，日常可以多吃黑木耳。黑木耳含有多种矿物质，能对各种结石产生强烈的化学反应，剥脱、分化、侵蚀结石，使结石缩小，排出。
由于尿路结石引起的肾积水，可以行体外震波碎石或者内镜下碎石取石治疗。病情较重，不允许做大手术，或者梗阻暂时不能去除，可以在超声引导下，经皮肾穿刺造瘘，将尿液直接引流进行治疗。输尿管炎性狭窄，或者晚期肿瘤压迫，引起的肾积水，可以经膀胱镜放置双j管，行内引流治疗。