如果是湿疣，要积极治疗。治疗原则，局部用药，每天涂药几次，肛周湿疣比普通湿疣治疗时间要长，但坚持治疗一样可以治好，不需吃药打针挂水等全身性治疗，激光、冷冻等常规的物理方法治标不治本，单独用多在短期内复发，可配合伤口涂药治好。
一般情况下，肛周脓肿患者初期，可出现肛门不舒服、胀痛或疼痛等症状，特别是排便后，患者还可出现烦躁、还不规则低热等症状，这是因为肛周脓肿多由肛腺反复感染引起，常见于免疫力低下或患有糖尿病的人。正常情况下，肛周脓肿都比较容易治愈，但如果治疗不彻底的话就可能出现复发问题。因此，建议肛周脓肿的患者应及时就诊，在医生指导下进行治疗。以免影响身体健康。
初期肛周脓肿可以选择有效的抗生素治疗。肛周脓肿多由肛腺感染经内外括约肌间隙向下经外括约肌皮下部向外扩散而成，常位于肛门周围皮下部。局部可见肛门边缘皮肤红肿，伴硬结和触痛，后期可有波动感。
肛周脓肿早期可以用抗生素来控制进一步发展，但是如果已经形成脓肿了那就不是吃药的问题了，那就需要手术治疗了。可以做肛门镜检查，以明确具体诊断，方便进一步治疗。
肛周脓肿是肛管及直肠周围软组织处由于细菌感染而形成的脓肿。在肛周脓肿的初期，主要还是表现为脓肿处的红肿及疼痛感。初期还是建议及时的使用抗生素进行抗感染治疗，在炎症消退后，脓肿缩小，红肿及疼痛消失。但是如果效果不佳，继续加重，还是需要手术切开引流的。
可采用抗感染治疗（包括针对需氧菌及厌氧菌的抗生素、中药清热解毒、疏泻通宣，通便、热水坐浴、理疗、休息等）。脓肿形成时，即应手术引流。切开排脓属于暂时性应急处理。可排出脓液，迅速减轻症状，但不能代替手术，一般约需3个月左右，待瘘管形成，内口明确，再行手术。
