宝宝睡觉摇头手脚乱动是因为孩子缺微量元素，表现为晚上睡觉不安稳，容易出汗，有枕秃，双下肢呈O型或者X型腿。可以查个微量元素，可以口服药物，每晚吃一次。一直吃到两三岁。
小宝宝睡觉摇头、手脚乱动是典型的缺少维生素D和钙的症状。缺钙的宝宝副交感神经兴奋，引起的腺体分泌增多、出汗多，汗液刺激宝宝头皮痒，这是宝宝摇头的原因，经常摇头可致头发脱落，形成枕秃。
一般宝宝在睡觉时摇头，湿疹是比较痒的，所以当枕部湿疹瘙痒时，会通过摇头来解痒，会导致头皮发痒，宝宝摇头来摩擦解痒。二，缺钙，宝宝的生长速度如果过快，没有及时补充维生素D，那么这个时候，就会出现摇头的现象。
引起婴儿入睡摇头晃脑的原因有很多种：
一是头痒，有个风俗是婴儿满月之前没有为婴儿洗发，使头发变得脏乱，若大量流汗，则可使头皮痒得难受，婴儿不表达，只靠摆头减轻痒状；
二是婴儿头湿疹，由于大量流汗或者穿厚厚的衣物，使湿疹发作，还会痒得很厉害，靠头前后磨蹭才能达到搔痒效果；
三是钙、维生素D不足可使婴儿大量流汗，头皮痒得厉害，使婴儿爱往返摩擦。
一般情况下，小孩睡觉摇头是缺乏微量元素、皮肤不适等原因引起的。
小孩睡觉摇头是缺乏维生素D或者是缺钙，造成孩子大脑皮层兴奋性增高，会引起睡觉的时候出现摇头、夜间睡眠不安稳、频繁的夜间惊醒等症状。小孩睡觉摇头是皮肤不适，如果皮肤上有事的话就会发痒，宝宝就会摇头，最好是用炉甘石洗剂涂擦。当积极的补充维生素D和钙、多晒太阳之后，宝宝睡觉摇头的症状就会逐渐的减少和消失。
