通常情况下，先天性的小脑畸形可以通过手术来治疗。
小脑扁桃体下疝畸形是先天性的，只有手术才能治疗。没有明显的临床表现或只有轻度头痛的病人，通常不需要进行任何的治疗。如果出现了明显的共济失调，比如走路不稳，或者是由于压迫、粘连所致的脑干、颅内神经损伤，就需要进行外科手术。手术方式以头后窝和颈髓减压为主，多数病人在术后症状有明显好转。
这可以用一些营养脑神经的药物，另外可以用一些改善脑循环的药物，有助于促进改善，另外还可以做高压氧治疗。先天性小脑萎缩没有什么特效的治疗方法，小脑的主要功能是负责平衡和协调运动，所以出现小脑萎缩，可以导致出现头晕症状，另外可以出现动作不协调，脑萎缩是神经病学中的一种疾病，通过影像诊断，现场表现可为痴呆、震颤、虚弱、共济失调等表现。脑萎缩是脑细胞的萎缩。每个脑细胞的减少会导致整个大脑体积的减少，从而改变大脑功能。脑萎缩无法治疗，因为脑细胞无法再生。
小脑最重要的功能就是控制人体平衡，还有调节肌张力和协调随意运动。小脑本身包括小脑半球和小脑蚓部，小脑半球受损表现为站立不稳，最主要是左右晃动，比如右侧小脑半球受损，走路时会向右侧倾斜，右侧肢体共济失调，指鼻子欠稳准；而小脑蚓部受损，表现为人体躯干平衡失调，常见前后站立不稳。一旦发现站立不稳，平衡失调。
贫血的时候可以多吃点胡萝卜、发菜、面筋等，这些食物都是铁质含量极其的丰富，而补血必须先补铁。另外平时也要多注意自己平时的身体状况，要及时的发现贫血的征兆。
遗传性小脑萎缩通常无法完全治好。如果得到积极治疗，病人的病情仍能得到一定程度的控制。对于小脑萎缩，主要采用改善返祖运动的药物进行治疗，也需要对症治疗。同时也需要干预可控的致病因素。
先天性颈椎畸形有一定的危险。
1.先天性颈椎畸形会造成颈部脊髓神经受压，造成肢体无力、疼痛、麻痹等症状，患者会出现肢体瘫痪，对患者的生活造成一定的负面影响。
2.先天性颈椎畸形还会引起椎动脉的走行方向的变化，会影响到大脑的血液供应，引起大脑的收缩，出现头晕恶心、胸闷心慌、走路不稳等症状。
3.先天性颈椎畸形在创伤后极易出现骨折和脱位，造成颈椎脊髓的损害，严重者甚至有可能威胁到患者的性命。
