同房第三天后吃避孕药有一定的作用。
一般情况下，紧急避孕需要在同房后的72小时内服用，并且服用的时间越早，避孕的机率也就越大。如果在同房三天后才服用避孕药，虽然也具有一定的效果，但是并不能保证避孕的机率。并且，服用紧急避孕药会具有一定的副作用，比如头疼、头晕、撤退性出血等，甚至影响到正常的月经。所以如果生育计划，在进行同房时最好进行正确的避孕。
大姨妈一般指月经。来月经第三天同房，可能容易导致妇科炎症感染。如果同房了，需要注意观察，如果没有不适症状，一般不要紧，因此月经期间发生性生活不一定会发生感染。但如果来月经第三天性生活以后出现出血量增多、小腹疼痛等症状，甚至出现发热的现象，需要及时就诊，进行必要的检查，遵医嘱给予相应的治疗，并且注意在月经期间禁止性生活。
月经结束后第三天同房是否会怀孕，要看月经期是几天，如果在七天内，月经干净后第三天是安全期同房基本是不会怀孕的，但也不能完全排除，也有排卵提前的可能。如果实在担心怀孕，还没有超过72小时，可以吃紧急避孕药进行补救避孕。
在性生活后72小时内吃紧急避孕药，可以起到补救作用，在月经前14天左右，排卵期可以有性生活，如果患者没有怀孕打算，就需要做好避孕措施，但是要注意吃紧急避孕药而不是短效避孕药。
排卵后三天同房是不会怀孕的。因为卵子排出以后，在体内存活的时间最长可以达到48小时。如果三天后，则是72小时，再同房是不会怀孕的。但是，需要卵子排出的时间是非常确定的。
在排卵过后的一天进行同房，如果没有采取避孕措施，有可能会怀孕。因为当女性的卵子排出以后，在体内可以存活24个小时，当精子进入女性的体内，可以在女性体内存活48个小时。
