小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
腹泻婴儿可分为两类，即感染性肠炎和消化不良。首先，你需要去医院做常规大便检查。如果大便有炎症，你应该考虑肠炎并使用抗炎药物来控制感染。如果婴儿年龄较小，且反复肠炎，也应考虑乳糖不耐受或肠道过敏的可能性。
婴儿腹泻推拿的方法是按揉宝宝的足三里，以膝盖髌骨下方的凸起处为起点，向下四指宽胫骨外侧，用大拇指的指肚按揉这一点100-200下。也可以把手掌摊开，放在宝宝的腹部，逆时针轻揉50下左右，但一定要逆时针揉腹，顺时针揉腹则是调理便秘的。还可以让宝宝平躺在床上，用一手的食指、中指、无名指并拢，用三指指腹在宝宝腹部绕圈按摩。以腕关节连同前臂作顺时针或逆时针方向环形移动摩擦，每次3-5分钟。
中成药有：附子理中丸，暖脐膏。虚寒泄的表现为：大便稀、肚子隐隐作痛，还可听到咕噜咕噜的声音，还有呕吐、头晕、不想吃饭、胸闷、喜食热饮、舌苔白腻。治疗湿热引起腹泻的中成药有：加味香连丸、胃肠宁冲剂。湿热泻的表现为：大便腥臭、肛门灼热，有里急后重感，口渴伴腹痛、舌红苔黄腻。治疗伤食引起腹泻的中成药有：木香槟榔丸、加味保和丸。
怀孕腹泻不止可以服用黄连药，蒙脱石散等药物进行治疗。
在怀孕期间，孕妇出现腹泻的情况，可以通过药物来进行治疗，比如黄连药，蒙脱石散等都是可以很大程度上的治疗腹泻的症状，同时孕妇也要注意腹部的保暖，避免病情反反复复。还可以补充肠道益生菌，能够帮助调节肠道菌群失衡，提高肠道功能，同时抑制肠道有害菌的过度滋生，来达到缓解腹泻的作用。
