对于上颌骨囊肿，应采取如下处理措施：采用全口弯曲断层片子和CT检查，确定囊肿的大小、与周边的联系。在全身麻醉时，传统的消毒、术区的渗透麻醉，用外科手术刀片直接切割上颌骨，大量的组织分离，取出粘骨膜，取出一部分骨头，露出囊内的囊，取出囊内的所有细胞。用碳酸盐烧灼骨壁上，完全清洗生理盐水，填充碘仿纱，并将伤口缝上。
胰腺炎后出现胰腺囊肿，可以通过使用药物、手术治疗、改善生活习惯等方法缓解相关症状。
1.使用药物：如果胰腺炎后出现胰腺囊肿，可以服用抗炎药物控制病情，如阿莫西林片、头孢地尼片等。
2.手术治疗：囊肿的体积增大或继发感染，则需要进行手术引流，能够有效缓解相关症状。
3.改善生活习惯：患者需要注意休息，养成良好的习惯，避免过度劳累。
要看囊肿的位置以及大小，如果是卵巢囊肿，有可能有生理性的怀孕后，由于体内激素升高导致的，不用特殊处理，一般可以自行消失。所以如果是卵巢囊肿的，要看囊肿的大小和性质，生理性卵巢囊肿直径一般不会超过五厘米，超声检查透声性会比较好，并且没有异常血流信号和分隔带等。
发现卵巢囊肿，需要观察，一般是在下次月经干净的第3天到第5天复查彩超。如果是生理性的囊肿，也就是所谓的黄体囊肿，在月经来潮之后会消失。如果月经干净之后持续存在，还是需要随访观察。
牙根囊肿通过手术来进行治疗，手术的方案需要看囊肿的位置、大小确定。如果是在前牙区且囊肿比较小，先进行根管治疗，通过手术切开翻瓣暴露囊肿，进行囊肿切除，同时去除囊肿内的根尖部分。再进行倒根充和封闭根尖孔，防止囊肿复发。
