口腔溃疡的治疗，主要是去除病因、增强体质、对症治疗。首先应该去除口腔内的不良刺激因素，比如残冠、残根、不良修复体、不良正畸等，同时戒烟限酒，不要吃辛辣刺激性的食物。其次多吃水果、蔬菜，多吃高蛋白的食物，补充机体所需要的营养及维生素。进行适当的体育锻炼，保持愉悦心情。口腔溃疡的局部保持清洁。
补充复合维生素B及维生素C。不要吃辛辣刺激性食物，多吃新鲜水果蔬菜五谷杂粮，果蔬含有大量维生素c，黑豆黑米红豆红枣薏仁米荞麦等杂粮粥含有大量维生素b族，可以提高机体免疫力，使口腔溃疡早日痊愈。
应多用清火祛湿类药物，如金银花、连翘、蒲公英、野菊花、车前子、滑石等。虚证者口腔溃疡会反复发作，较难愈合，应使用麦冬、生地黄、玉竹、石斛等药物进行治疗，也可局部使用冰硼散、锡类散等药物喷于患处。
怀孕初期口腔溃疡可以通过局部治疗来缓解。
这是由于口腔溃疡的治疗方式是以局部治疗为主，使用的药物一般都是在口腔局部上药，很少会出现口服的情况。治疗口腔溃疡要注意个人卫生，刷牙后用漱口水擦口，然后用药物薄膜敷在溃疡部位，平时多吃些富含维生素B、微量元素、锌硒的食物，如新鲜的蔬菜、水果等，还需要多饮水。
怀孕口腔溃疡可以口服维生素B2、维生素C等。
如果症状较轻可以服用维生素B2、维生素C等来进行治疗。如溃疡疼痛难以忍受，可外用药物治疗。部分外用药明确规定怀孕不可用，需注意避免。可使用漱口水、药膏、凝胶，涂抹于溃疡表面，可减轻疼痛、促进溃疡愈合。同时在治疗期间不能吃辛辣刺激性食物，以免加重病情。期间注意休息，不要劳累。
3岁儿童口腔溃疡比较常见，通常要做以下处理：
1.可以局部喷药，一般选择康复新液或者口腔炎喷雾剂，局部喷口腔溃疡处，促进修复，减轻疼痛感；
2.可以服用清热解毒降火的中成药，如羚羊角颗粒或喉咽清口服液等；
3.补充B族维生素；
4.做好饮食管理，需清淡饮食，避免油腻刺激性的食物摄入，以免加重孩子口腔不舒适的症状；
5.要勤漱口、刷牙，搞好口腔卫生，防止口腔溃疡继发细菌感染。
