智齿冠周炎的治疗方法包含局部治疗和全身治疗。局部治疗：主要是局部用双氧水、生理盐水等冲洗；全身治疗：主要是药物治疗，首选药物为消炎类的药物。另外，智齿冠周炎急性发作时，不能拔牙，否则可能导致炎症扩散，加重创伤，其治疗除了抗生素治疗外还需要支持疗法，增强机体抵抗力。
冠周炎一般采取冠周冲洗的方法进行治疗，通常用注射器抽取双氧水，生理盐水，并且将针尖去除，探入冠周牙龈与牙齿形成的盲袋底部，冲洗脓肿和食物残渣，反复冲洗，并擦干，然后用探针蘸上药。促进牙龈炎症消退。并且冲洗后建议一周左右使用漱口水。肿胀严重者建议使用抗生素抗炎治疗。
治疗智齿冠周炎的最好方法是应该考虑拔除的。智齿一般拔除的适应症还有导致邻牙损坏。坏的面积较大，无咬合功能。智齿大部分生长在口腔的最里面，也不好清洁，得牙龈炎，牙周炎的概率较高，有时会影响别的正常牙齿智齿冠周炎最好配合消炎治疗。
急性智齿冠周炎是由于第三磨牙萌出不全，上方覆盖龈袋，食物残渣容易存留其中，细菌滋生。当疲劳、烟酒刺激、感冒、熬夜等原因导致机体抵抗力下降时，易引起冠周炎发作。
智齿冠周炎的治疗原则主要是增强病人机体抵抗力，控制感染，选用抗菌药物或内服清热、解毒中草药促使炎症消散。急性期后，对病源牙采用外科治疗，以防复发。急性冠周炎如未彻底治疗，可转为慢性，以后反复发作，甚至遗留瘘管。若炎症继续扩展，可产生各种并发症。
