非淋球菌性尿道炎主要是感染了淋球菌以外的病原体，引起泌尿生殖系统的黏膜的炎症，主要是衣原体、支原体等。其临床表现主要表现一些尿道的刺激征状，如尿频、尿急、尿痛等尿路的刺激征状。
非淋菌性尿道炎可引起一系列并发症。可造成性功能障碍，如性欲减退、阳痿、早泄等，男子不育，植物神经功能紊乱，如烦躁易怒、精神萎靡、失眠多梦乏力等。非淋菌性尿道炎合并附睾炎者，会导致梗阻性无精子症，造成男性不育。另外，非淋菌性尿道炎还会导致睾丸炎、输精管炎等疾病。
非淋菌性尿道炎肛门坠，25岁以下占60%。男性可合并附睾炎，附睾肿大，发硬且有触痛，有的还可合并睾丸炎，前列腺炎等。女性可并发官颈炎，宫颈炎症和糜烂，分泌物增多，阴道及外阴瘙痒采用广谱抗生素疗法，并且强调要连续不间断用药，要规则、定量、彻底治疗。治疗后10－20天复查再次均为阴性，并用临床症状消失。本病治疗时所需的疗程较长。
非淋菌性尿道炎是指除了淋球菌之外的致病菌引起的尿道感染，目前主要是指由支原体、衣原体感染引起的尿道炎，多数是通过不洁性接触引起的。治疗上需要敏感的消炎药物治疗。每天注意个人私自的卫生清洁，勤换洗内裤，而且治疗期间禁止性生活。
男性非淋菌性尿道炎就是特指衣原体、支原体感染导致的尿道炎。这种病是有不洁做爱导致感染衣原体、支原体。症状有尿道痒、尿道疼痛，尿道口有稀薄的分泌液。对于男性非淋尿道炎，去正规医院配点的抗菌药物，治疗是七到十天。治疗期间建议不要做爱，减少夫妻双方交叉感染的机会。
非淋菌性尿道炎通常有不洁的性生活史，潜伏期，一般为1到3周。当发病后会出现尿道刺痒，伴有尿急，尿痛及排尿困难，但症状比淋菌性尿道炎轻。如果在较长时间内不排尿，或者是清晨首次排尿前尿道口可分泌出少量黏液性分泌物，有时候表现为尿道口被封住了，或者是裤裆污染。但有相当一部分人也没有任何的症状。所以一定要注意卫生。