肠镜主要是检查结、直肠的内窥镜。当肠道不舒适，排便习惯发生改变，如经常腹泻，或腹泻与便秘交替出现。或者是大便的性状发生改变，有黑便，柏油样便，或果酱样便。都应该及时的做肠镜检查。
肠镜检查又叫结肠镜检查，一般检查全结肠也就是大肠，一般肠镜检查从肛门经直肠乙状结肠，降结肠，横结肠，升结肠，到回盲瓣。如果要想检查小肠可以胶囊内镜，胶囊内镜可以检查全部消化道。
肠镜是一支细长可弯曲的医学仪器，直径大约1厘米，结肠镜通过肛门进入直肠，直到大肠，可让医生观察到结肠和大肠的内部情况。结肠镜检查是医生用来检查大肠及结肠内部病变的一种诊断方式。对人体安全无害。
结肠镜可以由肛门插入，直到盲肠端，可以观察盲肠，升结肠，横结肠，降结肠，乙状结肠，以及直肠的内壁情况，结肠镜是诊断结肠疾病的重要手段，同时也可以对结肠内的疾病进行组织活检或者治疗。检查是一次性的，并非分段多次，少数可能因为个体肠道异常或检查医生技术问题不能够检查到全结肠。
结肠镜检查是肠道疾病的常规检查。结肠镜检查只是一种复杂的肠道准备，它需要饮用肠液和腹泻。为了使肠道充满，便于观察，将少量二氧化碳气体注入肠道。病人有轻微的腹胀感。检查后，气体释放，对肠道没有影响，很快就会恢复正常。
有，体质较弱的人，灌肠次数太多，也会刺激到肠胃，引起肠内的菌群失调，灌肠的手法或操作不当，也有可能给肛门造成局部的损伤，污染到尿道或者阴道，会造成感染，或者引发肠穿孔等并发症。
