由于性早熟的孩子体格提前发育，骨骺愈合也提前，虽然开始阶段身材较同龄的孩子高，但最终性早熟的身高低于常人，典型的真性性早熟的患儿往往达不到150厘米。很多性早熟的其实是提前进入青春期，在一段时间内身高可以增长得很快，但是增长时期相对较短，也就是青春期缩短了。
一般情况下，性早熟之所以会影响长高，是因为性早熟患儿体格增长提前，骨骺提前闭合导致。具体分析如下：
通常来讲，从婴儿期到青春前期，由于中枢神经系统的抑制和性激素的负反馈作用，使下丘脑垂体性腺轴处于抑制状态，抑制作用过早去除会分泌更多的性激素，其中，男性睾酮可以促进骨骼的生长，从而出现短暂的生长高峰，同时钙、磷沉积加速骨骺愈合，导致身高过早定型；女性的雌激素会影响钙、磷的代谢，刺激成骨细胞的活动，促进骨骺愈合，影响后期长高。
一旦孩子出现性早熟，对身高是有些影响的，因此要找清楚造成性早熟的原因，以延缓性早熟。另外身高发育也不仅仅取决于性早熟，还有遗传因素，很多时候不是人为可以干预的。
发育过早，骨骼生长期就会缩短，骨骺过早闭合，身高就会停止生长，这将会影响终身身高。早熟的孩子因骨细胞分裂生殖能力不足，身高增长变得缓慢。此外大量的性激素又促使骺软骨过早闭合，使得生长自动停止。而正常发育的孩子通过未闭合的骺软骨不断增生新的软骨、变成成骨，直到20岁左右最终闭合为止，所以早熟的儿童比正常发育的儿童反而少生长了2—3年，导致成年后身材较矮小。
特发性中枢性性早熟，还有继发性中枢性性早熟的孩子，生长的可能性已经丧失，打针以后，身体内在的激素产生变化，其中性腺轴会被抑制。原来骨龄快速进展的，打针后就被有效的控制了，身高也可以随着年龄正常成长，长高的时间也正常了，慢慢地就能改善最终的身高。
