细菌感染通常是一定要用抗生素的。
在使用抗生素要在医师的指导下使用，不能确定是什么原因导致了菌群的紊乱，但是出现了细菌感染就必须使用抗生素，常见的抗生素有头孢拉定，头孢氨苄，红霉素，阿奇霉素，罗红霉素、头孢克圬，头孢曲松、庆大霉素，妥布霉素，阿米卡星等。有些感染，不能立即使用抗生素，会导致全身的炎症，严重的还有感染的情况。
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细菌感染通常使用的抗生素为头孢类或青霉素类，具体视病情严重程度而定，亦可用中药消炎治疗。
细菌感染是致病菌或条件致病菌进入血循环中进行生长繁殖，产生毒素和代谢产物引起感染。如果是重症患者，用中药副作用就比较小了。如果出现发烧、咳嗽等症状，可先服用退热药。注意，平时要多喝水。感冒后，要及时服用退热药和止咳剂等药物。注意休息、不熬夜，饮食宜清淡，不吃生、冷、辣、刺激的食品，帮助身体康复。
如果孩子是细菌感染所导致的肺炎，必须使用抗生素，如果孩子是属于非常轻微的肺炎，可以考虑口服抗生素治疗也是可以的。常用的抗生素包括头孢类的药物，或者是青霉素一类的药物，例如头孢克肟颗粒，头孢克洛干混悬剂和头孢羟氨苄，阿莫西林等，这些均是可以的。
细菌性心内膜炎抗生素治疗要注意以下用药原则：
第一，尽早使用，在三到五次的血液中进行持续的血液培养后进行。
第二，适当用药，有效的药物依赖于消毒，而不是抑制细菌，大的用量，长期的疗程，目的是彻底清除残留肿瘤中的细菌，同时使用各种药物，可以达到迅速的消毒效果。
第三，以输液为主要手段，维持血液的稳定水平。
第四，是在病因未知的情况下，急性期选择抗菌药物，如：链球菌、革兰氏阴性菌，亚急性者则选择抗链球菌。
c反应蛋白是一种蛋白质在人体受到感染或组织损伤后迅速升高的现象。c反应蛋白是急性炎症患者血清中结合肺炎链球菌蛋白的c多糖蛋白。
这是一种急性时相反应的指标，它不单单是感染会升高，还会出现其他创伤、心肌梗死、炎症、肿瘤甚至外科手术等组织坏死。c反应蛋白升高并不一定是细菌感染引起的，可能会出现病毒感染、真菌感染、其他非典型病原体感染等。c反应蛋白增高并出现感染症状时，应加强血培养、痰培养等降钙素原、病原微生物培养。
