肉芽肿分为全身性以及局部发作性，如果是全身性的肉芽肿通常都是一些全身性的感染导致的，也有部分病人是不明原因，或者是遗传而引起的。这种一般首先给予全身性的抗感染治疗。如果是局部的肉芽肿，最常见的就是局部的伤口里面有异物，常见的就是一些伤口受伤之后的一些泥沙或者其他异物导致在里面出现长期的炎症。
蕈样肉芽肿的治疗比较麻烦，需要慢慢的调理急不来的。主要的治疗方法是提高免疫力。蕈样肉芽肿属于皮肤疾病，一般无传染性。需要早期诊断早期治疗。如果治疗不及时的话，容易使病情发展成肿瘤，属于恶性肿瘤的一种，存活率很低，尚无明确的治疗方案。平时需要加强防护，避免风寒暑湿的感染，降低抵抗力。所以，蕈样肉芽肿早期是能治愈的。
肉芽肿性炎可能是感染性肉芽肿，细菌、螺旋体、真菌和寄生虫感染都有可能引起肉芽肿性炎，有可能是外来异物造成巨噬细胞增生引起的肉芽肿性炎，比如手术缝线、石棉和滑石粉等。
肺部出现炎性的肉芽肿，主要是肺组织出现炎症反应，炎症没有完全的消退，留有不同程度的增生，可以通过药物调理。对于肉芽肿压迫了肺部的气道而引起咳嗽、咳痰、胸闷、气短的时候，可以适当的使用支气管扩张剂。
肉芽肿乳腺炎其实是可以治疗的，尤其是在早期这种疾病的治疗可以使部分囊肿，只要及时治疗就会完全消失，在一定程度上是有局限性的，到了中期它会有化脓性的问题，通过药物治疗可以完全消肿，从而使溃疡完全痊愈。
