脑干出血后遗症多会表现为颅神经异常，眼球活动异常，眼球内收障碍、外展障碍，瞳孔可能也会出现异常，如果影响三叉神经脊束核，患者会出现改面部感觉异常，如果影响到面、舌神经核，可以出现面瘫，主要是中枢性面瘫，还有舌瘫伸舌偏向一侧。如果影响了双侧锥体束，患者会出现肢体无力、偏瘫。如果双侧受累就会出现四肢瘫。总之脑干的后遗症的临床表现，主要根据受损部位的不同而表现不同。
脑干出血如果相对症状比较轻微，仅仅有头痛、恶心、呕吐的症状，并且出血量相对较小，大约在5ml左右，没有产生明显的其他伴随症状，瞳孔以及呼吸、心跳这些节律都没有变化，可以通过药物的方式进行医治。
脑干出血能康复，在度过了急性期后，仍需要卧床休息2-4周的时间，尽量选择比较安静，阳光充裕的环境，避免情绪波动，同时可以给患者适当的使用软化大便的药物，以帮助顺利排便。有明显的精神症状，可以考虑使用一些抗焦虑，抗抑郁的药物来进行治疗。同时可以考虑给患者配合心理辅导，可以起到一定的帮助作用。
脑干出血是比较严重的，很容易影响到人的意识中枢的，出现昏迷的，甚至有生命危险的。需要及时积极的进行调整，待病情平稳以后，可能会慢慢恢复的。可以进一步进行检查，然后积极治疗来控制病情。
脑干出血患者的清醒时间主要取决于出血量的多少。如果出血量大约10ml，患者基本上没有清醒的可能性。因为在临床上脑干出血大于10ml，死亡率是接近100%。如果脑干出血量比较小，经过积极的保守治疗，比如脱水降颅压、清除氧自由基、护胃、营养神经等处理，一般在1周之内能够清醒。对于中等脑干出血的患者，早期经过积极的保守治疗，后期待病情稳定一般需要3周左右。
脑干的损伤，是否能苏醒、何时苏醒都是不能预测的。对于低血压患者饮食营养方面应给予高营养、易消化和富含维生素的饮食：适当补充维生素C、维生素B族和烟酰胺（维生素PP）等。
