用漱口水后仍需刷牙，漱口不能代替刷牙，只能作为口腔护理的辅助用品，无法彻底清除牙面上的菌斑及细小缝隙中残留的食物，不能完全发挥预防龋病的作用。治疗型和保健型漱口水使用前最好向医生咨询，抗菌成分的漱口水不适宜长期使用，容易引起口腔菌群的失调，引发一系列的口腔黏膜疾病。每天早晚2次刷牙非常必要。
没有能去除牙结石的漱口水，去牙结石的办法就是洗牙，用超声波振荡的方法来去除牙结石，在洗牙之后可以应用一些漱口水来治疗牙龈的炎症，并且使口腔的菌群环境保持协调一致，对洗牙进行巩固。
拔完牙以后不可以马上使用漱口水，需要拔完牙24小时以后才可以进行漱口、刷牙，漱口的动作太大会在口腔内形成快速的冲击，形成很大的压强，这样会导致拔牙创内的血凝块脱落。
会造成口干，灼热，长期使用治疗性漱口水容易使牙齿及口腔黏膜表面着色，使味蕾的味觉降低，并抑制唾液的分泌，造成口干，灼痛等不适症状。因此药物性漱口水需要在指导下有选择地使用，不能自行长期使用。
孕妇在怀孕期间，由于体内激素水平的升高，往往60%以上的孕妇会出现牙龈的水肿，感染牙龈炎，牙周炎的机会相对增多。在刷牙的时候往往会出现出血的现象，所以这种孕妇往往选择漱口水，所以孕妇是可以用漱口水的。但是要孕妇使用好的漱口水，也可以到口腔门诊去购买专业的漱口水。
