胎儿磁共振检查是帮助患者弥补超声检查不足的方法。当下，检查胎儿、胎盘和羊水状况的主要方法为产前超声，但受到孕妇肥胖、胎儿体位等因素的影响，产科超声无法进行检查，此时就需要进行磁共振检查。磁共振可以检测胎儿有无畸形、胎盘情况、羊水情况、子宫畸形、多胎、妊娠合并子宫肌瘤、卵巢肿瘤等情况。不过在怀孕的三个月内，胎儿的各个器官都在进行发生分化，所以不宜进行核磁共振检查。
一般情况下，小孩做脑CT和核磁共振有一定伤害，但是伤害较小。
小孩做脑CT，通常有一定的辐射损小孩的全身影响是比较小的，因为一次脑CT受到的辐射量通常是有限的，只要不是多次进行，一般不会造成较大的伤害。而核磁共振对于孩子的伤害则相对更小，因为核磁共振的成像一般和射线没有较为明显的关系，因次，也不会对小孩造成较为明显的辐射性损伤。
一般情况下，孕妇怀孕以后，有必要情况下，是可以根据病人的具体病情进行核磁共振检查的，但不建议行增强磁共振检查，也就是不建议用造影剂。
目前认为磁共振对胎儿是没有影响的，常常用于诊断胎儿看不清楚的畸形，或者用于诊断胎盘植入可疑，这时磁共振有时会看得更清楚，所以孕妇需要根据情况需要，可以在医生的指导下进行这项检查，这样可以减少因不行检查而影响病情判断后引起的相关风险的发生。
磁共振与核磁共振是相同的，无区别，磁共振产生的原理为原子核内部的核跟随体外磁场共同脉动。核磁共振与核武器、核辐射等产生的危害是不可同日而语的，核磁共振只是产生一个较小较轻的核磁场。
孕妇在怀孕期间最好不要做磁共振的。
一般在孕期不建议做核磁共振检查，特别是孕早期，因为孕早期是胎儿发育的最重要阶段。如果此时做核磁共振检查，磁场会影响胎儿的发育。另外有些检查需要服用造影剂，而造影剂对身体的伤害也比较大。为了安全起见，还是建议孕妇不要检查磁共振的，同时在怀孕期间一定要远离这些放射性的物质，尤其x射线，CT等。
磁共振和增强磁共振有区别。磁共振是直接核磁平扫，增强核磁共振是用造影剂后进行平扫这两者的去别在于，磁共振只能看到组织，而增强核磁共振对组织肿块进行检查更加彻底。
