如果结石比较少，也比较小，有咽部异物不适感，或常有气味臭的颗粒样物咳出，可到耳鼻咽喉科，让专业医生取出。如果扁桃体结石比较大，并经常性出现，或由于扁桃体结石存在，引起慢性扁桃体炎反复急性发作，需要行扁桃体切除手术治疗。
扁桃体结石，如果其只是微小的食物残渣慢慢堆积而成，其可以在饭前饭后以漱口为主，都可以清出来。如果清不出，可以考虑用剜匙或者镊子将比较大的扁桃体结石去除。
扁桃体结石是可以自己抠掉的，扁桃体结石，是由扁桃体的脱落上皮细胞和食物的残渣混合而形成的，和扁桃体的联系也不是十分紧密，并没有血液供应，不存在出血的可能，只要自己的方法得当，完全可以通过自己的努力把他清理出去。如果自己没有清理干净，可能还会反复发生，可以到医院治疗。如果反复多次发生，无法清理，可以手术切除双侧扁桃体。
扁桃体结石是可以根治的。扁桃体结石在临床上的发病率报道不一。通常多发生于扁桃体隐窝口或者是扁桃体实质内。是扁桃体表面的隐窝口发生堵塞，致使坏死细菌、脱落上皮细胞以及食物残渣逐渐堆积，慢慢随着钙盐沉淀机化，最终形成了扁桃体结石。对于隐窝口处的扁桃体结石，可以通过反复的清理去除。如果要求根治，那只有考虑同时切除扁桃体才可以。
不会引起了。因为扁桃体结石是会引起口臭，在临床上比较常见，患有扁桃体结石会有明显的咽部异物感、咽痛等症状，同时会有口腔异味，扁桃体结石在临床上主要的治疗办法为扁桃体切除手术，切除术后需口腔护理，对症抗炎治疗一周，扁桃体结石所产生的相应的临床症状可完全消失。
经常咳出扁桃体结石是因为没有保护口腔卫生，饭后未及时漱口，食物残渣长期隐藏在扁桃体隐窝形成的。随着人体的咳嗽动作是会被咳出来，但只是部位被咳出来，大部分扁桃体结石比较顽固，可以在喉镜下使用镊子夹取。
