脑部核磁共振没有电离辐射，对人体没有放射性的损害。其中脑部核磁共振是利用人体内氢质子，在磁场中产生共振信号来获得的图像。脑部的核磁共振对颅内的检查能够更精确，同时脑部核磁检查不会出现颅骨的伪影，也不需要造影剂，就能够清楚的显示头部冠状位、矢状位等图像。
腰疼拍CT还是核磁共振，需要根据具体情况来定：
第一种是腰椎间盘突出、腰椎管狭窄、腰椎压缩性骨折等疾病，可以采用CT扫描来明确诊断。第二，腰椎核磁检查的主要适用于高位腰椎间盘突出，以及多节段的腰椎间盘突出，一般CT不能完全反映腰椎的突出情况。所以当腰椎突出范围很大的时候，最好做核磁共振检查。另外，腰椎血管瘤、原发性腰椎、继发恶性等疾病，需要进行MRI检查，以明确病变存在部位、骨质破坏的情况。
脑部核磁共振不能查脑供血不足，可以通过脑部核磁共振观察颅内血管走形及各级分支，观察血管有无畸形，有无狭窄，闭塞等。脑供血不足，需做个脑血管造影才能明确的。
如果通过核磁共振检查到的结节不大时，而且对人体正常生活未造成影响，考虑先进行暂时性观察，再进行进一步的诊断，如果结节较大，考虑进行针对性治疗，必要时进行手术切除治疗。
大致都在2个小时左右可以拿结果，但在个别情况下可能会迟些。例如疑难病症，不能做出明确诊断，需要进行必要鉴别诊断和病例讨论，因此出具报告的时间会长些，可能会在第2天取报告。
脑部核磁共振检查没有明确的副作用，因为基本原理是探测人体组织内蕴藏量最丰富的氢离子，在磁共振过程中发出电磁波信号测出氢离子浓度及其驰豫时间，作为成像的参数。