半夜头疼疼醒可能是丛集性头痛，大多数发生于20岁-40岁青壮年，是一种神经血管性头痛，确切病因目前尚不明确，大多数人夜间发病，多数于入睡后1小时-2小时发病，通常为持续性的钻痛，疼痛剧烈难忍。
头疼引起的原因有，颈椎病压迫枕神经引起的枕大神经痛，引起后脑勺，头顶疼痛。颅内占位性疾病引起的高颅压头痛，长期服药引起的药物依赖性头痛，颅内压降低引起的低颅压头痛，和鼻窦炎引起的头痛等。原发性头痛主要指没有明确的原发疾病而出现的头痛，常见的有偏头痛，紧张性头痛，丛集性头痛。
主要是由于患者发生了神经性的头痛。因为日常生活当中，精神过度的紧张，压力过大或者过度的劳累，以及在睡前吃了辛辣刺激性的食物，都会出现睡觉半夜头痛的症状。另外，也常常见于偏胖的患者，在睡眠的过程当中打鼾，这时气道会出现反复发生低通气的状态，严重的还会出现呼吸困难。
后半夜头疼应该是神经衰弱或者是紧张性头痛，首先要注意放松，避免紧张焦虑，注意适当锻炼，提高睡眠质量，适当口服营养神经的药物，若无好转，要及时去医院完善相关检查，然后根据检查结果对症进行治疗。
在睡醒后出现了头部的疼痛问题，不能排除是因为存在了偏头痛的问题造成的，往往和睡眠不佳有直接的关系。需要及时的口服止疼的药物进行积极的治疗。同时注意增加休息，减少过度的劳累。如果不放心，可以考虑做一个颅脑的核磁共振检查。
头疼失眠可以服用的药物如下：
第一、头疼失眠的患者一般是紧张性头疼所导致，对于这种头疼的处理，可以服用非甾体类止痛药物，比如常用的布洛芬缓释胶囊、阿司匹林肠溶片等，也可以服用一些具有肌肉松弛作用的药物，因为紧张性头痛的患者肌肉筋膜都是紧张，比如可以服用盐酸乙哌立松片，也有一定的作用。
第二、患者可以服用一些苯二氮卓类的镇静催眠药，临床上用的有阿普唑仑片，氯硝西泮片，艾司唑仑片等，能改善失眠，同时对于头痛也有一定的缓解作用。
第三、患者可以服用抗焦虑抗抑郁的药物，因为长期头疼失眠的患者都是有焦虑、抑郁的情绪。
