慢性肾盂肾炎的治疗:一般治疗，注意个人卫生，摄入充足水分，定期排空膀胱，睡前排尿，可行二次排尿法。寻找复杂因素并去除，如手术解除梗阻或纠正反流等。应用抗生素治疗的原则：仅治疗有症状的细菌尿、用药之前行细菌培养并根据药敏结果选用抗生素、忌盲目使用抗生素而不注意去除复杂因素。
病人被诊断为慢性肾盂肾炎。慢性肾盂肾炎病人应注意病人的存在与否以及导致尿流不畅的因素的存在。导致尿流不畅的常见因素包括结石梗阻、肿瘤压迫或先天性尿路发育畸形等。病人加强尿彩色多普勒超声和尿路造影等辅助检查，以明确诊断。病人在进行抗感染治疗的同时，尽最大努力消除导致尿流不良的因素。慢性肾盂肾炎长期反复发作，可能会导致肾功能不全。
慢性肾盂肾炎的治疗分为普通治疗和抗感染治疗两部分，普通治疗包括多饮水，勤排尿；若伴有发烧，应对症降温处理，并卧床休息；若有结石或者畸形存在，可以进行外科治疗。抗感染治疗，针对培养细菌，进行相应抗感染治疗。治疗以后也需要每月复查1-2次，若有复发情况发生，则继续进行治疗，直到尿细菌培养为阴性为止。
治疗慢性肾盂肾炎费用的一般是1万-2万元左右。每个患者去到的医院有不相同的地方，渠道的科室里有不同级别的医生，医生的给出的治疗方法有不同，用药有不一样，都会有导致治疗费用出现不相同。
对于慢性肾盂肾炎的治疗方法，寻找并去除导致慢性肾盂肾炎发病的易感因素，解除尿路梗阻，纠正尿路畸形，提高机体免疫功能。已有肾功能损害的要注意维持水的平衡。有高血压的要降压治疗。要多注意休息。
如果出现了蛋白尿或水肿，可以选择利尿药来进行处理。一定要饮食清淡，绝对不能吃特别咸的食物，或者高油脂的食物，否则会增加肾脏负担。如果患有慢性肾盂肾炎，一定要从日常饮食上和使用药物上来综合调理，可以首先使用一些消炎的药物和激素类的药物，缓解肾脏部位的炎症。
