小的卵巢囊肿可以用中药治疗。患者可以尝试服用活血化瘀的中药进行治疗，常用的中药有当归、茯苓、益母草等等。患者还可服用中成药如桂枝茯苓丸等进行治疗，但由于患者体质不同，对于中药治疗的效果可能会有不同。如果卵巢囊肿超过了5cm，药物治疗不会有明显的效果，需要进行手术治疗。恶性卵巢囊肿则需要尽早的进行手术治疗，切不可只服用中药耽误了治疗时机。
附睾头囊肿用中药的方法治疗效果没有那么好，附睾的囊肿受到了细菌感染而引发的肿胀，附睾囊肿不大的情况下，可以使用一些抗生素治疗，如果附睾囊肿比较大的情况下，一定要去医院进行手术切除。
如果患者患有卵巢囊肿期间，出现了月经不调的情况，需要根据患者的实际情况进行用药。导致月经不调的原因有很多，中可能是身体虚弱、气血亏虚、饮食不当等因素导致的，可以遵医嘱选择乌鸡白凤丸进行调理，可以改善月经不调，有较好的效果。
如果是肝气郁结导致的月经不调，可以在医生的指导下选择逍遥丸，能够使病情好转。
目前还没有任何一种药物可以医治肾囊肿，中药也不例外。肾囊肿的医治主要是看囊肿的大小、位置以及临床症状，如果囊肿的径线小于5厘米，病患没有任何的临床症状，只需要定期复查超声，观察囊肿的变化就可以。
患有巧克力囊肿后，想要用中药方法治疗，一定要在医生的指导下使用。患者切不可自己用药，中药贴剂治疗、中药汤剂治疗，巧克力囊肿这是一种子宫内膜异位增生的病变，要重视疾病的治疗，中医认为治疗巧克力囊肿首选食疗，饮食上要有足够的营养，不要偏食挑食。不要吃牛、羊、鱼、虾等发物。
