肛肠镜检一般不会引起疼痛，但会有下腹部及肛门处胀胀的感觉病人可以耐受。镜检时会在肛门镜外壁涂抹石蜡油起到润滑的作用，方便镜子进入肛门。但如果肛门有病变，如肛裂、肛周脓肿、外痔及内痔炎症感染时，肛门镜检会因肛门镜摩擦病灶而出现疼痛不适。尤其是肛裂病人疼痛剧烈，原则上该类不予肛门镜检。
无痛肠镜检查一般是不痛苦的。具体情况分析如下：
无痛肠镜主要是用丙泊酚做全身麻醉的，病人在麻醉后是没有意识的，但是在做结肠镜的时候，需要注入适当的气体，观察肠腔的情况，为了观察病变，可能会反复的进镜观察，有时会导致肠腔内有大量气体，醒来后会出现肚子绞痛，顺时针揉肚子排出气体就可以了。总体来说，无痛肠镜是一个不错的选择。
检查无痛胃肠镜会进行人体麻醉，是不痛的，具体分析如下：
通过对病人进行麻醉剂的注射后，病人就会失去知觉，被检查时就不会感觉到疼痛。但是有呼吸暂停综合征、打鼾、喘鸣等症状的病人不宜进行无痛麻醉，也包括高龄、心脏功能不全、妊娠、等人群。目前在临床上，异泊酚是通过静脉注射的，异泊酚会在0.5-1min内失去知觉，停止使用药物后会很快苏醒并恢复知觉和方向感。
一般情况下，无痛胃肠镜检查是存在一定风险的。
无痛肠胃镜首先就是无痛这个过程,在麻醉时患者可能会存在心率减低、血压降低等疾病,甚至可能会出现恶性的心律失常的情况。另外像胃镜、肠镜检查,同样存在风险。比如胃镜检查时,患者可能会存在食道和胃的黏膜损伤、穿孔、出血、感染等。
建议患者需要多多休息，养成良好的生活习惯。
无痛肠镜是一种特殊的肠镜检查，是麻醉状态下的肠镜检查。跟普通的肠镜检查一样，都是将电子结肠镜插入肛门，观察肠管有没有糜烂、息肉、癌变等情况。相比于普通肠镜检查，无痛肠镜检查要求相对较高，要求病人的心肺功能基本健全，近期无咳嗽等上呼吸道感染症状。能够最大程度减轻肠镜给患者带来的痛楚，有助于保护患者的身体健康。
