非手术治疗：包括热水坐浴、通便、理疗，有急性炎症可菌培养后应用抗生素。非手术疗法只适用于反复发作的脓肿初期以及手术前准备，但不能彻底。手术治疗：挂线疗法或手术切除。肛瘘都有内口，切开或切除内口是肛瘘的关键。明确内口，加以处理，才能治肛瘘。避免复发。
肛瘘术一周之内夫妻是不应该同房的术后一周内伤口可能还没有恢复好这时进行夫妻生活可能会导致伤口的扩大或是感染等问题另外即使是结扎线头脱落了夫妻生活也会让身体下面局部出现充血、水肿等状态。
低位肛瘘指的是瘘管位置不穿过30%外括约肌的肛瘘，基本上是在肛周皮下的一些瘘管。除此之外，低位肛瘘还与肛门控便功能有关，很少引起肛门控便功能障碍的瘘管叫做低位肛瘘。
肛肠科的疾病手术后，都是非常疼的，尤其是在换药的时候，疼痛比较剧烈的，疼痛也是与个体耐受力有关系的。术后注意避免久坐，定时换药。保持个人清洁卫生，养成定时排便的好习惯。
低位肛瘘手术可以门诊手术，术后7到10天左右可以恢复。术后恢复多久还要看伤口和采用手术的方法，饮食要多喝水，多吃水果蔬菜，香蕉，苹果，猕猴桃，火龙果，芹菜，菠菜，木耳，蘑菇，冬瓜等，少吃辛辣，海鲜，辣椒，牛羊肉等。排便时间不宜过长控制在3到5分钟即可，平时不宜久蹲久站久坐，排便后有温水清洗肛门。
低位肛瘘微创术，现在线头在伤口内，这样通过能肛瘘的切割，就能让肛瘘慢慢愈合的，所以不用担心。或者按时到医院换药，让医生看看，样也有利于恢复。平时要注意少吃辛辣刺激的食物。
