支原体感染和病毒细菌感染是一样的，红霉素类的药物对于支原体感染效果是最好的，所以一般都选择这类药物，中医治疗支原体感染和治疗细菌病毒是一样的。主要以清热解毒化痰，还有调节免疫力为主。
普通的支原体感染肺炎，一般10-14天的疗程，咳嗽基本上就缓解了，咳嗽的症状可能会很明显持续的时间会很长，一般对于轻症的患者，如果能够及时给予抗支原体感染的治疗，咳嗽症状会比较快地缓解。
衣原体感染用红霉素类、四环素类消炎药。
衣原体感染病人可应用红霉素，罗红霉素和阿奇霉素等红霉素类药物，疗效较好。还有四环素类药物，如四环素，盐酸米诺环素疗效亦较理想。如疗效欠佳，可选用喹诺酮类药物，例如莫西沙星，具有抗菌谱广，组织穿透力强。
但是以上药物都需要在医生的指导下使用。
衣原体感染后，患者可以在医生的指导下吃红霉素、罗红霉素、多西环素、米诺环素、阿奇霉素、克拉霉素等，这些抗生素对支原体和衣原体都是有效的。
不推荐使用头孢菌素、喹诺酮类的抗感染药物，这些药物对支原体、衣原体的治疗效果都不是很好。支原体、衣原体感染需要服用7-10天的药物来治疗。
衣原体感染用大环内酯类的抗生素好。
衣原体感染肺炎，可以服用大环内酯的药物，常用的药物有红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等。患者可以根据医生的建议服用，一般服用2周以上，可以减轻感冒，防止呼吸道感染。另外，患者在平时应注意个人卫生，避免不洁的性生活。
小儿支原体感染是感染支原体引起的疾病，通过飞沫传播，潜伏期比较长，可以到2-3周，病程也比较长。肺部的病变较重，炎症吸收慢，出现干咳，或转为顽固性的剧烈咳嗽，偶有痰中带血，呼吸困难。