用于细菌或真菌引起的急、慢性肠炎、腹泻。也可用于其他原因引起的胃肠道菌群失调的防治。以活菌进入肠道后，对葡萄球菌、酵母样菌等致病菌有拮抗作用，而对双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌、消化链球菌有促进生长作用，从而可调整菌群失调达到治疗目的。
香砂六君丸能与木香顺气丸一起吃，没什么太大的冲突。木香顺气丸具有行气化湿，健脾和胃的作用，多用于湿浊中阻、脾胃不和所致的胸膈痞闷、脘腹胀痛、呕吐恶心、嗳气纳呆。香砂六君丸用于脾胃气虚、湿阻痰聚、气滞胃逆所引起的胃脘痛、呕吐、消化不良、暖气食少、头晕肢乏、面色萎黄、口淡多痰、时吐清水或大便溏泄等症。现代多用于胃溃疡、十二指肠溃疡、慢性胃炎、慢性肝炎、慢性胆囊炎、妊娠反应、胃下垂等症。
香砂六君丸能与木香顺气丸一起吃，没什么太大的冲突。木香顺气丸具有行气化湿，健脾和胃的作用，多用于湿浊中阻、脾胃不和所致的胸膈痞闷、脘腹胀痛、呕吐恶心、嗳气纳呆。香砂六君丸用于脾胃气虚、湿阻痰聚、气滞胃逆所引起的胃脘痛、呕吐、消化不良、暖气食少、头晕肢乏、面色萎黄、口淡多痰、时吐清水或大便溏泄等症。现代多用于胃溃疡、十二指肠溃疡、慢性胃炎、慢性肝炎、慢性胆囊炎、妊娠反应、胃下垂等症。
吃香砂六君丸可能会上火，具体分析如下：
香砂六君丸由木香、砂仁、党参、白术、茯苓、甘草、陈皮、半夏、生姜、大枣等组成，是一种具有益气健脾和胃作用的中药。适用于脾胃虚弱、气滞、厌食、食欲不振、脘腹胀满、大便稀薄、舌质薄、苔白腻。香砂六君丸全方性味辛温，脾胃虚寒之人服用。如果出现口干、口唇生疮、口唇生疮等症状，就算是脾胃虚寒的人也不能吃。
香砂六君丸是健脾药，一般宜饭后服用。不宜饭前服用。化性的药物宜饭后服用，香砂六君丸是中医比较经典的治疗胃部不适、食欲不佳、消化不良的中成药，效果不错。建议在饭后吃，这样能有效的发挥这个药消食的功效。最好空腹服用。可于饭后两小时服用。
香砂六君丸主要的功效是可以益气健脾、和胃，用于治疗脾虚气滞导致的消化不良、脘腹胀满、大便溏稀这样的症状。这个药物中的党参起到大补元气，还有益气、健脾、养胃的作用。白术可以健脾燥湿、加强益气的作用。茯苓可以健脾渗湿。陈皮、半夏可以燥湿化痰。木香、砂仁可以行气调中止痛。炙甘草来益气和中，还可以调和诸药。